Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EYA3Q99504 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EYA3Q99504 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
EYA3Q99504 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EYA3Q99504 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
EYA3Q99504 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
EYA3Q99504 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EYA3Q99504 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
EYA3Q99504 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
EYA3Q99504 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EYA3Q99504 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EYA3Q99504 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
EYA3Q99504 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
EYA3Q99504 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
EYA3Q99504 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
EYA3Q99504 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
EYA3Q99504 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
EYA3Q99504 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
EYA3Q99504 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EYA3Q99504 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
EYA3Q99504 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EYA3Q99504 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EYA3Q99504 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
EYA3Q99504 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
EYA3Q99504 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EYA3Q99504 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EYA3Q99504 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
EYA3Q99504 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EYA3Q99504 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EYA3Q99504 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EYA3Q99504 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
EYA3Q99504 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EYA3Q99504 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EYA3Q99504 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EYA3Q99504 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
EYA3Q99504 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
EYA3Q99504 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
EYA3Q99504 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
EYA3Q99504 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
EYA3Q99504 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
EYA3Q99504 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
EYA3Q99504 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EYA3Q99504 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EYA3Q99504 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
EYA3Q99504 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EYA3Q99504 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EYA3Q99504 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EYA3Q99504 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EYA3Q99504 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EYA3Q99504 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EYA3Q99504 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EYA3Q99504 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EYA3Q99504 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
EYA3Q99504 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EYA3Q99504 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
EYA3Q99504 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EYA3Q99504 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EYA3Q99504 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EYA3Q99504 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
EYA3Q99504 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
EYA3Q99504 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
EYA3Q99504 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
EYA3Q99504 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
EYA3Q99504 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
EYA3Q99504 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EYA3Q99504 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EYA3Q99504 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EYA3Q99504 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EYA3Q99504 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EYA3Q99504 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EYA3Q99504 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EYA3Q99504 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
EYA3Q99504 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EYA3Q99504 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EYA3Q99504 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EYA3Q99504 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EYA3Q99504 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EYA3Q99504 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
EYA3Q99504 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EYA3Q99504 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EYA3Q99504 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EYA3Q99504 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EYA3Q99504 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EYA3Q99504 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EYA3Q99504 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EYA3Q99504 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EYA3Q99504 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EYA3Q99504 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EYA3Q99504 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
EYA3Q99504 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EYA3Q99504 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EYA3Q99504 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EYA3Q99504 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EYA3Q99504 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EYA3Q99504 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EYA3Q99504 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EYA3Q99504 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EYA3Q99504 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EYA3Q99504 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
EYA3Q99504 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms