Protein–RNA interactions for Protein: Q96T88

UHRF1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF1Q96T88 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UHRF1Q96T88 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UHRF1Q96T88 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UHRF1Q96T88 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UHRF1Q96T88 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UHRF1Q96T88 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UHRF1Q96T88 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UHRF1Q96T88 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UHRF1Q96T88 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
UHRF1Q96T88 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UHRF1Q96T88 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UHRF1Q96T88 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UHRF1Q96T88 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UHRF1Q96T88 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UHRF1Q96T88 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UHRF1Q96T88 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
UHRF1Q96T88 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UHRF1Q96T88 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UHRF1Q96T88 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UHRF1Q96T88 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UHRF1Q96T88 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
UHRF1Q96T88 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
UHRF1Q96T88 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UHRF1Q96T88 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UHRF1Q96T88 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UHRF1Q96T88 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UHRF1Q96T88 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UHRF1Q96T88 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UHRF1Q96T88 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UHRF1Q96T88 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UHRF1Q96T88 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UHRF1Q96T88 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UHRF1Q96T88 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UHRF1Q96T88 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UHRF1Q96T88 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UHRF1Q96T88 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UHRF1Q96T88 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UHRF1Q96T88 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UHRF1Q96T88 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UHRF1Q96T88 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UHRF1Q96T88 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UHRF1Q96T88 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UHRF1Q96T88 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UHRF1Q96T88 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UHRF1Q96T88 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UHRF1Q96T88 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UHRF1Q96T88 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UHRF1Q96T88 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UHRF1Q96T88 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
UHRF1Q96T88 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UHRF1Q96T88 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UHRF1Q96T88 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UHRF1Q96T88 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UHRF1Q96T88 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UHRF1Q96T88 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UHRF1Q96T88 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UHRF1Q96T88 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UHRF1Q96T88 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UHRF1Q96T88 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UHRF1Q96T88 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UHRF1Q96T88 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UHRF1Q96T88 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UHRF1Q96T88 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UHRF1Q96T88 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
UHRF1Q96T88 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UHRF1Q96T88 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UHRF1Q96T88 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UHRF1Q96T88 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UHRF1Q96T88 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UHRF1Q96T88 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UHRF1Q96T88 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UHRF1Q96T88 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UHRF1Q96T88 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UHRF1Q96T88 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UHRF1Q96T88 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UHRF1Q96T88 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UHRF1Q96T88 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UHRF1Q96T88 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UHRF1Q96T88 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UHRF1Q96T88 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UHRF1Q96T88 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UHRF1Q96T88 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UHRF1Q96T88 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UHRF1Q96T88 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UHRF1Q96T88 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UHRF1Q96T88 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UHRF1Q96T88 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UHRF1Q96T88 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UHRF1Q96T88 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UHRF1Q96T88 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UHRF1Q96T88 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UHRF1Q96T88 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UHRF1Q96T88 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UHRF1Q96T88 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
UHRF1Q96T88 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UHRF1Q96T88 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UHRF1Q96T88 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UHRF1Q96T88 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UHRF1Q96T88 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UHRF1Q96T88 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms