Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CSRNP1Q96S65 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CSRNP1Q96S65 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CSRNP1Q96S65 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CSRNP1Q96S65 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CSRNP1Q96S65 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CSRNP1Q96S65 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CSRNP1Q96S65 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CSRNP1Q96S65 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CSRNP1Q96S65 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CSRNP1Q96S65 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CSRNP1Q96S65 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CSRNP1Q96S65 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CSRNP1Q96S65 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CSRNP1Q96S65 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CSRNP1Q96S65 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CSRNP1Q96S65 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CSRNP1Q96S65 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CSRNP1Q96S65 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CSRNP1Q96S65 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CSRNP1Q96S65 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CSRNP1Q96S65 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CSRNP1Q96S65 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CSRNP1Q96S65 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CSRNP1Q96S65 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CSRNP1Q96S65 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CSRNP1Q96S65 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CSRNP1Q96S65 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
CSRNP1Q96S65 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CSRNP1Q96S65 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CSRNP1Q96S65 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CSRNP1Q96S65 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CSRNP1Q96S65 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CSRNP1Q96S65 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CSRNP1Q96S65 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CSRNP1Q96S65 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CSRNP1Q96S65 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CSRNP1Q96S65 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CSRNP1Q96S65 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CSRNP1Q96S65 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CSRNP1Q96S65 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CSRNP1Q96S65 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CSRNP1Q96S65 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CSRNP1Q96S65 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CSRNP1Q96S65 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CSRNP1Q96S65 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CSRNP1Q96S65 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CSRNP1Q96S65 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CSRNP1Q96S65 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CSRNP1Q96S65 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CSRNP1Q96S65 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CSRNP1Q96S65 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CSRNP1Q96S65 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CSRNP1Q96S65 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CSRNP1Q96S65 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CSRNP1Q96S65 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CSRNP1Q96S65 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CSRNP1Q96S65 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CSRNP1Q96S65 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CSRNP1Q96S65 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CSRNP1Q96S65 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CSRNP1Q96S65 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CSRNP1Q96S65 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CSRNP1Q96S65 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CSRNP1Q96S65 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CSRNP1Q96S65 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CSRNP1Q96S65 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CSRNP1Q96S65 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CSRNP1Q96S65 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CSRNP1Q96S65 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CSRNP1Q96S65 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CSRNP1Q96S65 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CSRNP1Q96S65 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CSRNP1Q96S65 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CSRNP1Q96S65 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CSRNP1Q96S65 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CSRNP1Q96S65 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CSRNP1Q96S65 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CSRNP1Q96S65 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CSRNP1Q96S65 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CSRNP1Q96S65 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CSRNP1Q96S65 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CSRNP1Q96S65 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CSRNP1Q96S65 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CSRNP1Q96S65 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CSRNP1Q96S65 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CSRNP1Q96S65 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CSRNP1Q96S65 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CSRNP1Q96S65 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CSRNP1Q96S65 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CSRNP1Q96S65 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CSRNP1Q96S65 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CSRNP1Q96S65 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CSRNP1Q96S65 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CSRNP1Q96S65 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CSRNP1Q96S65 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CSRNP1Q96S65 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CSRNP1Q96S65 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CSRNP1Q96S65 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CSRNP1Q96S65 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms