Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39■■■■□ 3.83
IFT140Q96RY7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
IFT140Q96RY7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
IFT140Q96RY7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC39■■■■□ 3.83
IFT140Q96RY7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC39■■■■□ 3.83
IFT140Q96RY7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC39■■■■□ 3.83
IFT140Q96RY7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
IFT140Q96RY7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
IFT140Q96RY7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC38.99■■■■□ 3.83
IFT140Q96RY7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
IFT140Q96RY7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.99■■■■□ 3.83
IFT140Q96RY7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
IFT140Q96RY7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
IFT140Q96RY7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
IFT140Q96RY7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC38.98■■■■□ 3.83
IFT140Q96RY7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
IFT140Q96RY7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
IFT140Q96RY7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC38.98■■■■□ 3.83
IFT140Q96RY7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC38.98■■■■□ 3.83
IFT140Q96RY7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC38.98■■■■□ 3.83
IFT140Q96RY7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
IFT140Q96RY7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC38.97■■■■□ 3.83
IFT140Q96RY7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC38.96■■■■□ 3.83
IFT140Q96RY7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.96■■■■□ 3.83
IFT140Q96RY7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC38.96■■■■□ 3.83
IFT140Q96RY7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC38.96■■■■□ 3.83
IFT140Q96RY7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.96■■■■□ 3.83
IFT140Q96RY7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
IFT140Q96RY7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
IFT140Q96RY7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
IFT140Q96RY7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
IFT140Q96RY7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
IFT140Q96RY7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
IFT140Q96RY7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
IFT140Q96RY7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
IFT140Q96RY7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
IFT140Q96RY7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC38.92■■■■□ 3.82
IFT140Q96RY7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC38.92■■■■□ 3.82
IFT140Q96RY7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
IFT140Q96RY7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC38.92■■■■□ 3.82
IFT140Q96RY7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC38.91■■■■□ 3.82
IFT140Q96RY7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.91■■■■□ 3.82
IFT140Q96RY7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
IFT140Q96RY7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
IFT140Q96RY7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC38.9■■■■□ 3.82
IFT140Q96RY7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC38.9■■■■□ 3.82
IFT140Q96RY7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC38.9■■■■□ 3.82
IFT140Q96RY7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
IFT140Q96RY7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
IFT140Q96RY7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC38.89■■■■□ 3.82
IFT140Q96RY7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
IFT140Q96RY7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
IFT140Q96RY7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
IFT140Q96RY7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC38.88■■■■□ 3.81
IFT140Q96RY7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.81
IFT140Q96RY7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
IFT140Q96RY7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC38.87■■■■□ 3.81
IFT140Q96RY7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
IFT140Q96RY7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC38.87■■■■□ 3.81
IFT140Q96RY7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
IFT140Q96RY7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.87■■■■□ 3.81
IFT140Q96RY7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC38.86■■■■□ 3.81
IFT140Q96RY7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
IFT140Q96RY7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
IFT140Q96RY7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
IFT140Q96RY7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC38.86■■■■□ 3.81
IFT140Q96RY7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC38.85■■■■□ 3.81
IFT140Q96RY7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
IFT140Q96RY7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
IFT140Q96RY7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
IFT140Q96RY7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
IFT140Q96RY7 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
IFT140Q96RY7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
IFT140Q96RY7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
IFT140Q96RY7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC38.83■■■■□ 3.81
IFT140Q96RY7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
IFT140Q96RY7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC38.82■■■■□ 3.81
IFT140Q96RY7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
IFT140Q96RY7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
IFT140Q96RY7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
IFT140Q96RY7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC38.81■■■■□ 3.8
IFT140Q96RY7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC38.81■■■■□ 3.8
IFT140Q96RY7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
IFT140Q96RY7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8
IFT140Q96RY7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
IFT140Q96RY7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.8■■■■□ 3.8
IFT140Q96RY7 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
IFT140Q96RY7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC38.79■■■■□ 3.8
IFT140Q96RY7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
IFT140Q96RY7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
IFT140Q96RY7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
IFT140Q96RY7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
IFT140Q96RY7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
IFT140Q96RY7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC38.79■■■■□ 3.8
IFT140Q96RY7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
IFT140Q96RY7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
IFT140Q96RY7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC38.78■■■■□ 3.8
IFT140Q96RY7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC38.78■■■■□ 3.8
IFT140Q96RY7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
IFT140Q96RY7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms