Protein–RNA interactions for Protein: Q96RQ3

MCCC1, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCC1Q96RQ3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCCC1Q96RQ3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCCC1Q96RQ3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCCC1Q96RQ3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCCC1Q96RQ3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCCC1Q96RQ3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCCC1Q96RQ3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCCC1Q96RQ3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCCC1Q96RQ3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCCC1Q96RQ3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCCC1Q96RQ3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MCCC1Q96RQ3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCCC1Q96RQ3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCCC1Q96RQ3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCCC1Q96RQ3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MCCC1Q96RQ3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCCC1Q96RQ3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCCC1Q96RQ3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCCC1Q96RQ3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCCC1Q96RQ3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MCCC1Q96RQ3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCCC1Q96RQ3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCCC1Q96RQ3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCCC1Q96RQ3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCCC1Q96RQ3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCCC1Q96RQ3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCCC1Q96RQ3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCCC1Q96RQ3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCCC1Q96RQ3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCCC1Q96RQ3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCCC1Q96RQ3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCCC1Q96RQ3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCCC1Q96RQ3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCCC1Q96RQ3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MCCC1Q96RQ3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MCCC1Q96RQ3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCCC1Q96RQ3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCCC1Q96RQ3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCCC1Q96RQ3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCCC1Q96RQ3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCCC1Q96RQ3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCCC1Q96RQ3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCCC1Q96RQ3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCCC1Q96RQ3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCCC1Q96RQ3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCCC1Q96RQ3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCCC1Q96RQ3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCCC1Q96RQ3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MCCC1Q96RQ3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCCC1Q96RQ3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCCC1Q96RQ3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCCC1Q96RQ3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCCC1Q96RQ3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCCC1Q96RQ3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCCC1Q96RQ3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCCC1Q96RQ3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCCC1Q96RQ3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCCC1Q96RQ3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCCC1Q96RQ3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCCC1Q96RQ3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCCC1Q96RQ3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCCC1Q96RQ3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCCC1Q96RQ3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MCCC1Q96RQ3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCCC1Q96RQ3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCCC1Q96RQ3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCCC1Q96RQ3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCCC1Q96RQ3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MCCC1Q96RQ3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCCC1Q96RQ3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCCC1Q96RQ3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCCC1Q96RQ3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCCC1Q96RQ3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCCC1Q96RQ3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCCC1Q96RQ3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MCCC1Q96RQ3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCCC1Q96RQ3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCCC1Q96RQ3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCCC1Q96RQ3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCCC1Q96RQ3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MCCC1Q96RQ3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MCCC1Q96RQ3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MCCC1Q96RQ3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MCCC1Q96RQ3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MCCC1Q96RQ3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
MCCC1Q96RQ3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MCCC1Q96RQ3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCCC1Q96RQ3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCCC1Q96RQ3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCCC1Q96RQ3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCCC1Q96RQ3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCCC1Q96RQ3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCCC1Q96RQ3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCCC1Q96RQ3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCCC1Q96RQ3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MCCC1Q96RQ3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MCCC1Q96RQ3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MCCC1Q96RQ3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MCCC1Q96RQ3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCCC1Q96RQ3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms