Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB3IPQ96QF0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB3IPQ96QF0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB3IPQ96QF0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB3IPQ96QF0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB3IPQ96QF0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB3IPQ96QF0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB3IPQ96QF0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB3IPQ96QF0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB3IPQ96QF0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB3IPQ96QF0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB3IPQ96QF0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB3IPQ96QF0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB3IPQ96QF0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB3IPQ96QF0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB3IPQ96QF0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB3IPQ96QF0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB3IPQ96QF0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB3IPQ96QF0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB3IPQ96QF0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB3IPQ96QF0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB3IPQ96QF0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB3IPQ96QF0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB3IPQ96QF0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB3IPQ96QF0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB3IPQ96QF0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB3IPQ96QF0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB3IPQ96QF0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB3IPQ96QF0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB3IPQ96QF0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB3IPQ96QF0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB3IPQ96QF0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB3IPQ96QF0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB3IPQ96QF0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB3IPQ96QF0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB3IPQ96QF0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB3IPQ96QF0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB3IPQ96QF0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB3IPQ96QF0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB3IPQ96QF0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB3IPQ96QF0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB3IPQ96QF0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB3IPQ96QF0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB3IPQ96QF0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB3IPQ96QF0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB3IPQ96QF0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB3IPQ96QF0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB3IPQ96QF0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB3IPQ96QF0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB3IPQ96QF0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB3IPQ96QF0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB3IPQ96QF0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB3IPQ96QF0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB3IPQ96QF0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB3IPQ96QF0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB3IPQ96QF0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB3IPQ96QF0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB3IPQ96QF0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB3IPQ96QF0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB3IPQ96QF0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB3IPQ96QF0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB3IPQ96QF0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB3IPQ96QF0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB3IPQ96QF0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB3IPQ96QF0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB3IPQ96QF0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB3IPQ96QF0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB3IPQ96QF0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB3IPQ96QF0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB3IPQ96QF0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB3IPQ96QF0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB3IPQ96QF0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB3IPQ96QF0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB3IPQ96QF0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB3IPQ96QF0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB3IPQ96QF0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB3IPQ96QF0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB3IPQ96QF0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB3IPQ96QF0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB3IPQ96QF0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAB3IPQ96QF0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB3IPQ96QF0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB3IPQ96QF0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB3IPQ96QF0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB3IPQ96QF0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB3IPQ96QF0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB3IPQ96QF0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB3IPQ96QF0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB3IPQ96QF0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB3IPQ96QF0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB3IPQ96QF0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB3IPQ96QF0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB3IPQ96QF0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB3IPQ96QF0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB3IPQ96QF0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB3IPQ96QF0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB3IPQ96QF0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB3IPQ96QF0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB3IPQ96QF0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB3IPQ96QF0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms