Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE2

ARHGEF17, Rho guanine nucleotide exchange factor 17, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF17Q96PE2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARHGEF17Q96PE2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARHGEF17Q96PE2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ARHGEF17Q96PE2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ARHGEF17Q96PE2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGEF17Q96PE2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGEF17Q96PE2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGEF17Q96PE2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGEF17Q96PE2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGEF17Q96PE2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARHGEF17Q96PE2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARHGEF17Q96PE2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARHGEF17Q96PE2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARHGEF17Q96PE2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARHGEF17Q96PE2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARHGEF17Q96PE2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ARHGEF17Q96PE2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARHGEF17Q96PE2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARHGEF17Q96PE2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARHGEF17Q96PE2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARHGEF17Q96PE2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARHGEF17Q96PE2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARHGEF17Q96PE2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARHGEF17Q96PE2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGEF17Q96PE2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGEF17Q96PE2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGEF17Q96PE2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGEF17Q96PE2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGEF17Q96PE2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGEF17Q96PE2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGEF17Q96PE2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGEF17Q96PE2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGEF17Q96PE2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGEF17Q96PE2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGEF17Q96PE2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGEF17Q96PE2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGEF17Q96PE2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGEF17Q96PE2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGEF17Q96PE2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGEF17Q96PE2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGEF17Q96PE2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGEF17Q96PE2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGEF17Q96PE2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGEF17Q96PE2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGEF17Q96PE2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGEF17Q96PE2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGEF17Q96PE2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGEF17Q96PE2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGEF17Q96PE2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGEF17Q96PE2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF17Q96PE2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF17Q96PE2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF17Q96PE2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF17Q96PE2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF17Q96PE2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF17Q96PE2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF17Q96PE2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF17Q96PE2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF17Q96PE2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF17Q96PE2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF17Q96PE2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF17Q96PE2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF17Q96PE2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF17Q96PE2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF17Q96PE2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF17Q96PE2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF17Q96PE2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF17Q96PE2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARHGEF17Q96PE2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARHGEF17Q96PE2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARHGEF17Q96PE2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARHGEF17Q96PE2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARHGEF17Q96PE2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARHGEF17Q96PE2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARHGEF17Q96PE2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF17Q96PE2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF17Q96PE2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF17Q96PE2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF17Q96PE2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF17Q96PE2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF17Q96PE2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF17Q96PE2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF17Q96PE2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF17Q96PE2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGEF17Q96PE2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGEF17Q96PE2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGEF17Q96PE2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGEF17Q96PE2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGEF17Q96PE2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGEF17Q96PE2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGEF17Q96PE2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGEF17Q96PE2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGEF17Q96PE2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGEF17Q96PE2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGEF17Q96PE2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGEF17Q96PE2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGEF17Q96PE2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGEF17Q96PE2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF17Q96PE2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF17Q96PE2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms