Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NLRP3Q96P20 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NLRP3Q96P20 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NLRP3Q96P20 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NLRP3Q96P20 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NLRP3Q96P20 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
NLRP3Q96P20 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NLRP3Q96P20 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NLRP3Q96P20 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NLRP3Q96P20 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NLRP3Q96P20 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NLRP3Q96P20 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NLRP3Q96P20 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NLRP3Q96P20 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NLRP3Q96P20 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NLRP3Q96P20 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NLRP3Q96P20 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NLRP3Q96P20 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
NLRP3Q96P20 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NLRP3Q96P20 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NLRP3Q96P20 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NLRP3Q96P20 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NLRP3Q96P20 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NLRP3Q96P20 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NLRP3Q96P20 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
NLRP3Q96P20 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NLRP3Q96P20 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NLRP3Q96P20 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NLRP3Q96P20 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NLRP3Q96P20 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NLRP3Q96P20 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NLRP3Q96P20 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NLRP3Q96P20 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
NLRP3Q96P20 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
NLRP3Q96P20 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NLRP3Q96P20 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
NLRP3Q96P20 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NLRP3Q96P20 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NLRP3Q96P20 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NLRP3Q96P20 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NLRP3Q96P20 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NLRP3Q96P20 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NLRP3Q96P20 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
NLRP3Q96P20 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
NLRP3Q96P20 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
NLRP3Q96P20 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NLRP3Q96P20 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NLRP3Q96P20 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NLRP3Q96P20 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NLRP3Q96P20 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
NLRP3Q96P20 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NLRP3Q96P20 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NLRP3Q96P20 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NLRP3Q96P20 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NLRP3Q96P20 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NLRP3Q96P20 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NLRP3Q96P20 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NLRP3Q96P20 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NLRP3Q96P20 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NLRP3Q96P20 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NLRP3Q96P20 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
NLRP3Q96P20 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NLRP3Q96P20 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NLRP3Q96P20 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NLRP3Q96P20 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NLRP3Q96P20 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NLRP3Q96P20 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NLRP3Q96P20 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NLRP3Q96P20 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NLRP3Q96P20 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NLRP3Q96P20 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
NLRP3Q96P20 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NLRP3Q96P20 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NLRP3Q96P20 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
NLRP3Q96P20 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
NLRP3Q96P20 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NLRP3Q96P20 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NLRP3Q96P20 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NLRP3Q96P20 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NLRP3Q96P20 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NLRP3Q96P20 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NLRP3Q96P20 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NLRP3Q96P20 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
NLRP3Q96P20 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
NLRP3Q96P20 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NLRP3Q96P20 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NLRP3Q96P20 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NLRP3Q96P20 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NLRP3Q96P20 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
NLRP3Q96P20 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
NLRP3Q96P20 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
NLRP3Q96P20 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NLRP3Q96P20 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NLRP3Q96P20 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NLRP3Q96P20 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NLRP3Q96P20 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NLRP3Q96P20 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NLRP3Q96P20 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NLRP3Q96P20 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NLRP3Q96P20 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms