Protein–RNA interactions for Protein: Q96NZ9

PRAP1, Proline-rich acidic protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAP1Q96NZ9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAP1Q96NZ9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAP1Q96NZ9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAP1Q96NZ9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAP1Q96NZ9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAP1Q96NZ9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAP1Q96NZ9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAP1Q96NZ9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAP1Q96NZ9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAP1Q96NZ9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAP1Q96NZ9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAP1Q96NZ9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAP1Q96NZ9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAP1Q96NZ9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAP1Q96NZ9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAP1Q96NZ9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAP1Q96NZ9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAP1Q96NZ9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAP1Q96NZ9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAP1Q96NZ9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAP1Q96NZ9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAP1Q96NZ9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAP1Q96NZ9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAP1Q96NZ9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAP1Q96NZ9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAP1Q96NZ9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAP1Q96NZ9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAP1Q96NZ9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAP1Q96NZ9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAP1Q96NZ9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAP1Q96NZ9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAP1Q96NZ9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAP1Q96NZ9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAP1Q96NZ9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAP1Q96NZ9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAP1Q96NZ9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAP1Q96NZ9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAP1Q96NZ9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAP1Q96NZ9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAP1Q96NZ9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAP1Q96NZ9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAP1Q96NZ9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAP1Q96NZ9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAP1Q96NZ9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAP1Q96NZ9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAP1Q96NZ9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAP1Q96NZ9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAP1Q96NZ9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAP1Q96NZ9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAP1Q96NZ9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAP1Q96NZ9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAP1Q96NZ9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAP1Q96NZ9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAP1Q96NZ9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAP1Q96NZ9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAP1Q96NZ9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAP1Q96NZ9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAP1Q96NZ9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAP1Q96NZ9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRAP1Q96NZ9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAP1Q96NZ9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAP1Q96NZ9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAP1Q96NZ9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAP1Q96NZ9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAP1Q96NZ9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAP1Q96NZ9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAP1Q96NZ9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAP1Q96NZ9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAP1Q96NZ9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAP1Q96NZ9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAP1Q96NZ9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAP1Q96NZ9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAP1Q96NZ9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAP1Q96NZ9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAP1Q96NZ9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAP1Q96NZ9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAP1Q96NZ9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAP1Q96NZ9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAP1Q96NZ9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAP1Q96NZ9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAP1Q96NZ9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAP1Q96NZ9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAP1Q96NZ9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAP1Q96NZ9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAP1Q96NZ9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAP1Q96NZ9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAP1Q96NZ9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAP1Q96NZ9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAP1Q96NZ9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAP1Q96NZ9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAP1Q96NZ9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAP1Q96NZ9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAP1Q96NZ9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAP1Q96NZ9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAP1Q96NZ9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAP1Q96NZ9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAP1Q96NZ9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAP1Q96NZ9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAP1Q96NZ9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAP1Q96NZ9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms