Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW7

LRRC7, Leucine-rich repeat-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC7Q96NW7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
LRRC7Q96NW7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
LRRC7Q96NW7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
LRRC7Q96NW7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
LRRC7Q96NW7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
LRRC7Q96NW7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
LRRC7Q96NW7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
LRRC7Q96NW7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
LRRC7Q96NW7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
LRRC7Q96NW7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
LRRC7Q96NW7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
LRRC7Q96NW7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
LRRC7Q96NW7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
LRRC7Q96NW7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
LRRC7Q96NW7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
LRRC7Q96NW7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
LRRC7Q96NW7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
LRRC7Q96NW7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
LRRC7Q96NW7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
LRRC7Q96NW7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
LRRC7Q96NW7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
LRRC7Q96NW7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
LRRC7Q96NW7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
LRRC7Q96NW7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
LRRC7Q96NW7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
LRRC7Q96NW7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
LRRC7Q96NW7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
LRRC7Q96NW7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
LRRC7Q96NW7 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
LRRC7Q96NW7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
LRRC7Q96NW7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
LRRC7Q96NW7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
LRRC7Q96NW7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
LRRC7Q96NW7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
LRRC7Q96NW7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
LRRC7Q96NW7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
LRRC7Q96NW7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
LRRC7Q96NW7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
LRRC7Q96NW7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
LRRC7Q96NW7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
LRRC7Q96NW7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
LRRC7Q96NW7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
LRRC7Q96NW7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
LRRC7Q96NW7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
LRRC7Q96NW7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
LRRC7Q96NW7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
LRRC7Q96NW7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
LRRC7Q96NW7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
LRRC7Q96NW7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
LRRC7Q96NW7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
LRRC7Q96NW7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
LRRC7Q96NW7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
LRRC7Q96NW7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
LRRC7Q96NW7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
LRRC7Q96NW7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC32.71■■■□□ 2.83
LRRC7Q96NW7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
LRRC7Q96NW7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
LRRC7Q96NW7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
LRRC7Q96NW7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.82
LRRC7Q96NW7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
LRRC7Q96NW7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
LRRC7Q96NW7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
LRRC7Q96NW7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
LRRC7Q96NW7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
LRRC7Q96NW7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
LRRC7Q96NW7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
LRRC7Q96NW7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
LRRC7Q96NW7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
LRRC7Q96NW7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
LRRC7Q96NW7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
LRRC7Q96NW7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
LRRC7Q96NW7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
LRRC7Q96NW7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
LRRC7Q96NW7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
LRRC7Q96NW7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
LRRC7Q96NW7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
LRRC7Q96NW7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
LRRC7Q96NW7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
LRRC7Q96NW7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
LRRC7Q96NW7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
LRRC7Q96NW7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
LRRC7Q96NW7 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
LRRC7Q96NW7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
LRRC7Q96NW7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
LRRC7Q96NW7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
LRRC7Q96NW7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
LRRC7Q96NW7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
LRRC7Q96NW7 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
LRRC7Q96NW7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
LRRC7Q96NW7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
LRRC7Q96NW7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
LRRC7Q96NW7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
LRRC7Q96NW7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
LRRC7Q96NW7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
LRRC7Q96NW7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
LRRC7Q96NW7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
LRRC7Q96NW7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
LRRC7Q96NW7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
LRRC7Q96NW7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
LRRC7Q96NW7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms