Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL6

SCLT1, Sodium channel and clathrin linker 1, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCLT1Q96NL6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCLT1Q96NL6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCLT1Q96NL6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCLT1Q96NL6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCLT1Q96NL6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCLT1Q96NL6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCLT1Q96NL6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCLT1Q96NL6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCLT1Q96NL6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCLT1Q96NL6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCLT1Q96NL6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCLT1Q96NL6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCLT1Q96NL6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCLT1Q96NL6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCLT1Q96NL6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCLT1Q96NL6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCLT1Q96NL6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SCLT1Q96NL6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCLT1Q96NL6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCLT1Q96NL6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCLT1Q96NL6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCLT1Q96NL6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCLT1Q96NL6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCLT1Q96NL6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCLT1Q96NL6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCLT1Q96NL6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCLT1Q96NL6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCLT1Q96NL6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCLT1Q96NL6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCLT1Q96NL6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCLT1Q96NL6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SCLT1Q96NL6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCLT1Q96NL6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCLT1Q96NL6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SCLT1Q96NL6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCLT1Q96NL6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCLT1Q96NL6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCLT1Q96NL6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCLT1Q96NL6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SCLT1Q96NL6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCLT1Q96NL6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCLT1Q96NL6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCLT1Q96NL6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCLT1Q96NL6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCLT1Q96NL6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCLT1Q96NL6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCLT1Q96NL6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCLT1Q96NL6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCLT1Q96NL6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCLT1Q96NL6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCLT1Q96NL6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SCLT1Q96NL6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SCLT1Q96NL6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCLT1Q96NL6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCLT1Q96NL6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCLT1Q96NL6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCLT1Q96NL6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCLT1Q96NL6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCLT1Q96NL6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCLT1Q96NL6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCLT1Q96NL6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCLT1Q96NL6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCLT1Q96NL6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCLT1Q96NL6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCLT1Q96NL6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCLT1Q96NL6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCLT1Q96NL6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCLT1Q96NL6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCLT1Q96NL6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCLT1Q96NL6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCLT1Q96NL6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCLT1Q96NL6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCLT1Q96NL6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCLT1Q96NL6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCLT1Q96NL6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCLT1Q96NL6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCLT1Q96NL6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SCLT1Q96NL6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCLT1Q96NL6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCLT1Q96NL6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCLT1Q96NL6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCLT1Q96NL6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCLT1Q96NL6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCLT1Q96NL6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCLT1Q96NL6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCLT1Q96NL6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCLT1Q96NL6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCLT1Q96NL6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCLT1Q96NL6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCLT1Q96NL6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCLT1Q96NL6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCLT1Q96NL6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCLT1Q96NL6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCLT1Q96NL6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCLT1Q96NL6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCLT1Q96NL6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCLT1Q96NL6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCLT1Q96NL6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCLT1Q96NL6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCLT1Q96NL6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms