Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW5

COG8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG8Q96MW5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COG8Q96MW5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COG8Q96MW5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COG8Q96MW5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COG8Q96MW5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COG8Q96MW5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COG8Q96MW5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COG8Q96MW5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COG8Q96MW5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COG8Q96MW5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COG8Q96MW5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COG8Q96MW5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COG8Q96MW5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COG8Q96MW5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COG8Q96MW5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COG8Q96MW5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COG8Q96MW5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COG8Q96MW5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COG8Q96MW5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COG8Q96MW5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COG8Q96MW5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COG8Q96MW5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
COG8Q96MW5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COG8Q96MW5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COG8Q96MW5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COG8Q96MW5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COG8Q96MW5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COG8Q96MW5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COG8Q96MW5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COG8Q96MW5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COG8Q96MW5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COG8Q96MW5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COG8Q96MW5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COG8Q96MW5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COG8Q96MW5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
COG8Q96MW5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COG8Q96MW5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COG8Q96MW5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COG8Q96MW5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COG8Q96MW5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COG8Q96MW5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COG8Q96MW5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COG8Q96MW5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COG8Q96MW5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COG8Q96MW5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COG8Q96MW5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COG8Q96MW5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COG8Q96MW5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COG8Q96MW5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COG8Q96MW5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COG8Q96MW5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COG8Q96MW5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
COG8Q96MW5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
COG8Q96MW5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COG8Q96MW5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COG8Q96MW5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COG8Q96MW5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COG8Q96MW5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COG8Q96MW5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COG8Q96MW5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COG8Q96MW5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COG8Q96MW5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COG8Q96MW5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COG8Q96MW5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
COG8Q96MW5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COG8Q96MW5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
COG8Q96MW5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
COG8Q96MW5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
COG8Q96MW5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
COG8Q96MW5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
COG8Q96MW5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
COG8Q96MW5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COG8Q96MW5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COG8Q96MW5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COG8Q96MW5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COG8Q96MW5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COG8Q96MW5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COG8Q96MW5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COG8Q96MW5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COG8Q96MW5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COG8Q96MW5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COG8Q96MW5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COG8Q96MW5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COG8Q96MW5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COG8Q96MW5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COG8Q96MW5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COG8Q96MW5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COG8Q96MW5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COG8Q96MW5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
COG8Q96MW5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COG8Q96MW5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COG8Q96MW5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COG8Q96MW5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COG8Q96MW5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
COG8Q96MW5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COG8Q96MW5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COG8Q96MW5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COG8Q96MW5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COG8Q96MW5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COG8Q96MW5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms