Protein–RNA interactions for Protein: Q96LM1

LINC00615, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00615, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00615Q96LM1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LINC00615Q96LM1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LINC00615Q96LM1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LINC00615Q96LM1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LINC00615Q96LM1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LINC00615Q96LM1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LINC00615Q96LM1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LINC00615Q96LM1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LINC00615Q96LM1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LINC00615Q96LM1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00615Q96LM1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00615Q96LM1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00615Q96LM1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00615Q96LM1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00615Q96LM1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00615Q96LM1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00615Q96LM1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINC00615Q96LM1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LINC00615Q96LM1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LINC00615Q96LM1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINC00615Q96LM1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LINC00615Q96LM1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LINC00615Q96LM1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC00615Q96LM1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC00615Q96LM1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC00615Q96LM1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC00615Q96LM1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC00615Q96LM1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00615Q96LM1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00615Q96LM1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00615Q96LM1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00615Q96LM1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00615Q96LM1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00615Q96LM1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00615Q96LM1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00615Q96LM1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00615Q96LM1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00615Q96LM1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00615Q96LM1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00615Q96LM1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00615Q96LM1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00615Q96LM1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00615Q96LM1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00615Q96LM1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00615Q96LM1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00615Q96LM1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LINC00615Q96LM1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LINC00615Q96LM1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LINC00615Q96LM1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LINC00615Q96LM1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LINC00615Q96LM1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LINC00615Q96LM1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00615Q96LM1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00615Q96LM1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00615Q96LM1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00615Q96LM1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00615Q96LM1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00615Q96LM1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00615Q96LM1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00615Q96LM1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00615Q96LM1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00615Q96LM1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC00615Q96LM1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC00615Q96LM1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC00615Q96LM1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC00615Q96LM1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC00615Q96LM1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC00615Q96LM1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC00615Q96LM1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC00615Q96LM1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00615Q96LM1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00615Q96LM1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00615Q96LM1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00615Q96LM1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00615Q96LM1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00615Q96LM1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00615Q96LM1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00615Q96LM1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00615Q96LM1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00615Q96LM1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00615Q96LM1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00615Q96LM1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00615Q96LM1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00615Q96LM1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC00615Q96LM1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC00615Q96LM1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC00615Q96LM1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC00615Q96LM1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC00615Q96LM1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC00615Q96LM1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC00615Q96LM1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC00615Q96LM1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC00615Q96LM1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC00615Q96LM1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC00615Q96LM1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC00615Q96LM1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC00615Q96LM1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC00615Q96LM1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC00615Q96LM1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00615Q96LM1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms