Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ALPK3Q96L96 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ALPK3Q96L96 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ALPK3Q96L96 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ALPK3Q96L96 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ALPK3Q96L96 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ALPK3Q96L96 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ALPK3Q96L96 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ALPK3Q96L96 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ALPK3Q96L96 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ALPK3Q96L96 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ALPK3Q96L96 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ALPK3Q96L96 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ALPK3Q96L96 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ALPK3Q96L96 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ALPK3Q96L96 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ALPK3Q96L96 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ALPK3Q96L96 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ALPK3Q96L96 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ALPK3Q96L96 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ALPK3Q96L96 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ALPK3Q96L96 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ALPK3Q96L96 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ALPK3Q96L96 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ALPK3Q96L96 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ALPK3Q96L96 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ALPK3Q96L96 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ALPK3Q96L96 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ALPK3Q96L96 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ALPK3Q96L96 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ALPK3Q96L96 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ALPK3Q96L96 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ALPK3Q96L96 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ALPK3Q96L96 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ALPK3Q96L96 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ALPK3Q96L96 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ALPK3Q96L96 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ALPK3Q96L96 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ALPK3Q96L96 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ALPK3Q96L96 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ALPK3Q96L96 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ALPK3Q96L96 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ALPK3Q96L96 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ALPK3Q96L96 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ALPK3Q96L96 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ALPK3Q96L96 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ALPK3Q96L96 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ALPK3Q96L96 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ALPK3Q96L96 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ALPK3Q96L96 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ALPK3Q96L96 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ALPK3Q96L96 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ALPK3Q96L96 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ALPK3Q96L96 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ALPK3Q96L96 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ALPK3Q96L96 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ALPK3Q96L96 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ALPK3Q96L96 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ALPK3Q96L96 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ALPK3Q96L96 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ALPK3Q96L96 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ALPK3Q96L96 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ALPK3Q96L96 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ALPK3Q96L96 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ALPK3Q96L96 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ALPK3Q96L96 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ALPK3Q96L96 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ALPK3Q96L96 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ALPK3Q96L96 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ALPK3Q96L96 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ALPK3Q96L96 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ALPK3Q96L96 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ALPK3Q96L96 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ALPK3Q96L96 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ALPK3Q96L96 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ALPK3Q96L96 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ALPK3Q96L96 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ALPK3Q96L96 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ALPK3Q96L96 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ALPK3Q96L96 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ALPK3Q96L96 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ALPK3Q96L96 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ALPK3Q96L96 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ALPK3Q96L96 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ALPK3Q96L96 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ALPK3Q96L96 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
ALPK3Q96L96 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ALPK3Q96L96 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ALPK3Q96L96 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ALPK3Q96L96 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ALPK3Q96L96 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ALPK3Q96L96 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ALPK3Q96L96 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ALPK3Q96L96 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ALPK3Q96L96 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ALPK3Q96L96 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ALPK3Q96L96 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ALPK3Q96L96 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ALPK3Q96L96 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ALPK3Q96L96 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms