Protein–RNA interactions for Protein: Q96K49

TMEM87B, Transmembrane protein 87B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87BQ96K49 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMEM87BQ96K49 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMEM87BQ96K49 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMEM87BQ96K49 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMEM87BQ96K49 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMEM87BQ96K49 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM87BQ96K49 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM87BQ96K49 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM87BQ96K49 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM87BQ96K49 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM87BQ96K49 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
TMEM87BQ96K49 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMEM87BQ96K49 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMEM87BQ96K49 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMEM87BQ96K49 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMEM87BQ96K49 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMEM87BQ96K49 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMEM87BQ96K49 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TMEM87BQ96K49 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMEM87BQ96K49 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMEM87BQ96K49 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMEM87BQ96K49 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TMEM87BQ96K49 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TMEM87BQ96K49 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TMEM87BQ96K49 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
TMEM87BQ96K49 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMEM87BQ96K49 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMEM87BQ96K49 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMEM87BQ96K49 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMEM87BQ96K49 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMEM87BQ96K49 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMEM87BQ96K49 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TMEM87BQ96K49 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMEM87BQ96K49 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMEM87BQ96K49 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMEM87BQ96K49 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMEM87BQ96K49 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMEM87BQ96K49 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMEM87BQ96K49 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMEM87BQ96K49 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMEM87BQ96K49 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM87BQ96K49 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM87BQ96K49 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM87BQ96K49 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMEM87BQ96K49 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMEM87BQ96K49 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMEM87BQ96K49 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMEM87BQ96K49 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TMEM87BQ96K49 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMEM87BQ96K49 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TMEM87BQ96K49 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMEM87BQ96K49 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMEM87BQ96K49 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMEM87BQ96K49 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMEM87BQ96K49 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMEM87BQ96K49 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMEM87BQ96K49 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMEM87BQ96K49 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM87BQ96K49 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM87BQ96K49 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM87BQ96K49 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM87BQ96K49 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM87BQ96K49 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM87BQ96K49 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM87BQ96K49 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM87BQ96K49 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM87BQ96K49 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM87BQ96K49 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM87BQ96K49 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM87BQ96K49 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM87BQ96K49 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM87BQ96K49 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM87BQ96K49 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMEM87BQ96K49 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMEM87BQ96K49 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMEM87BQ96K49 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMEM87BQ96K49 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMEM87BQ96K49 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMEM87BQ96K49 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMEM87BQ96K49 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMEM87BQ96K49 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMEM87BQ96K49 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMEM87BQ96K49 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM87BQ96K49 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM87BQ96K49 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM87BQ96K49 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM87BQ96K49 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM87BQ96K49 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM87BQ96K49 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM87BQ96K49 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM87BQ96K49 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM87BQ96K49 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM87BQ96K49 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM87BQ96K49 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMEM87BQ96K49 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMEM87BQ96K49 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMEM87BQ96K49 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMEM87BQ96K49 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMEM87BQ96K49 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMEM87BQ96K49 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms