Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CELF6Q96J87 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CELF6Q96J87 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CELF6Q96J87 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CELF6Q96J87 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CELF6Q96J87 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CELF6Q96J87 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CELF6Q96J87 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CELF6Q96J87 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CELF6Q96J87 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CELF6Q96J87 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CELF6Q96J87 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CELF6Q96J87 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CELF6Q96J87 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CELF6Q96J87 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CELF6Q96J87 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CELF6Q96J87 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CELF6Q96J87 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CELF6Q96J87 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CELF6Q96J87 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CELF6Q96J87 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CELF6Q96J87 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CELF6Q96J87 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CELF6Q96J87 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CELF6Q96J87 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CELF6Q96J87 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CELF6Q96J87 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CELF6Q96J87 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CELF6Q96J87 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CELF6Q96J87 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CELF6Q96J87 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CELF6Q96J87 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CELF6Q96J87 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CELF6Q96J87 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CELF6Q96J87 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CELF6Q96J87 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CELF6Q96J87 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CELF6Q96J87 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CELF6Q96J87 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CELF6Q96J87 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CELF6Q96J87 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CELF6Q96J87 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CELF6Q96J87 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CELF6Q96J87 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CELF6Q96J87 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CELF6Q96J87 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CELF6Q96J87 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CELF6Q96J87 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CELF6Q96J87 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CELF6Q96J87 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CELF6Q96J87 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CELF6Q96J87 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CELF6Q96J87 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CELF6Q96J87 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CELF6Q96J87 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CELF6Q96J87 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CELF6Q96J87 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CELF6Q96J87 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CELF6Q96J87 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CELF6Q96J87 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CELF6Q96J87 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CELF6Q96J87 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CELF6Q96J87 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CELF6Q96J87 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CELF6Q96J87 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CELF6Q96J87 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CELF6Q96J87 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CELF6Q96J87 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CELF6Q96J87 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CELF6Q96J87 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CELF6Q96J87 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CELF6Q96J87 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CELF6Q96J87 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CELF6Q96J87 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CELF6Q96J87 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CELF6Q96J87 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CELF6Q96J87 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CELF6Q96J87 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CELF6Q96J87 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CELF6Q96J87 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CELF6Q96J87 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CELF6Q96J87 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CELF6Q96J87 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CELF6Q96J87 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CELF6Q96J87 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CELF6Q96J87 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CELF6Q96J87 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CELF6Q96J87 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CELF6Q96J87 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CELF6Q96J87 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CELF6Q96J87 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CELF6Q96J87 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CELF6Q96J87 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CELF6Q96J87 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CELF6Q96J87 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CELF6Q96J87 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CELF6Q96J87 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CELF6Q96J87 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CELF6Q96J87 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CELF6Q96J87 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms