Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZBED3Q96IU2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZBED3Q96IU2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZBED3Q96IU2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ZBED3Q96IU2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZBED3Q96IU2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZBED3Q96IU2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZBED3Q96IU2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZBED3Q96IU2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ZBED3Q96IU2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZBED3Q96IU2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZBED3Q96IU2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZBED3Q96IU2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZBED3Q96IU2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZBED3Q96IU2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZBED3Q96IU2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZBED3Q96IU2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZBED3Q96IU2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZBED3Q96IU2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ZBED3Q96IU2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZBED3Q96IU2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ZBED3Q96IU2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ZBED3Q96IU2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ZBED3Q96IU2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ZBED3Q96IU2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ZBED3Q96IU2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ZBED3Q96IU2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ZBED3Q96IU2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZBED3Q96IU2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ZBED3Q96IU2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ZBED3Q96IU2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ZBED3Q96IU2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ZBED3Q96IU2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZBED3Q96IU2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZBED3Q96IU2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZBED3Q96IU2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZBED3Q96IU2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZBED3Q96IU2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZBED3Q96IU2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ZBED3Q96IU2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ZBED3Q96IU2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZBED3Q96IU2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZBED3Q96IU2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZBED3Q96IU2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZBED3Q96IU2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ZBED3Q96IU2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ZBED3Q96IU2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZBED3Q96IU2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ZBED3Q96IU2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ZBED3Q96IU2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZBED3Q96IU2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ZBED3Q96IU2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ZBED3Q96IU2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZBED3Q96IU2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ZBED3Q96IU2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ZBED3Q96IU2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZBED3Q96IU2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZBED3Q96IU2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZBED3Q96IU2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ZBED3Q96IU2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZBED3Q96IU2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
ZBED3Q96IU2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ZBED3Q96IU2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ZBED3Q96IU2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
ZBED3Q96IU2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZBED3Q96IU2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZBED3Q96IU2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZBED3Q96IU2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZBED3Q96IU2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZBED3Q96IU2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZBED3Q96IU2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZBED3Q96IU2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ZBED3Q96IU2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZBED3Q96IU2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZBED3Q96IU2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZBED3Q96IU2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZBED3Q96IU2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZBED3Q96IU2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZBED3Q96IU2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZBED3Q96IU2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZBED3Q96IU2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZBED3Q96IU2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZBED3Q96IU2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZBED3Q96IU2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ZBED3Q96IU2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ZBED3Q96IU2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZBED3Q96IU2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZBED3Q96IU2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ZBED3Q96IU2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZBED3Q96IU2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZBED3Q96IU2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZBED3Q96IU2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZBED3Q96IU2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZBED3Q96IU2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZBED3Q96IU2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZBED3Q96IU2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZBED3Q96IU2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZBED3Q96IU2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZBED3Q96IU2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZBED3Q96IU2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms