Protein–RNA interactions for Protein: Q96HF1

SFRP2, Secreted frizzled-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP2Q96HF1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFRP2Q96HF1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFRP2Q96HF1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFRP2Q96HF1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFRP2Q96HF1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFRP2Q96HF1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFRP2Q96HF1 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFRP2Q96HF1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFRP2Q96HF1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFRP2Q96HF1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFRP2Q96HF1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFRP2Q96HF1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFRP2Q96HF1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFRP2Q96HF1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFRP2Q96HF1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFRP2Q96HF1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFRP2Q96HF1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFRP2Q96HF1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFRP2Q96HF1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFRP2Q96HF1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFRP2Q96HF1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFRP2Q96HF1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFRP2Q96HF1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFRP2Q96HF1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFRP2Q96HF1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFRP2Q96HF1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFRP2Q96HF1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFRP2Q96HF1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFRP2Q96HF1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFRP2Q96HF1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFRP2Q96HF1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFRP2Q96HF1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFRP2Q96HF1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFRP2Q96HF1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFRP2Q96HF1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SFRP2Q96HF1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFRP2Q96HF1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFRP2Q96HF1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFRP2Q96HF1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFRP2Q96HF1 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFRP2Q96HF1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFRP2Q96HF1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFRP2Q96HF1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFRP2Q96HF1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFRP2Q96HF1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFRP2Q96HF1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFRP2Q96HF1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SFRP2Q96HF1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFRP2Q96HF1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFRP2Q96HF1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SFRP2Q96HF1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFRP2Q96HF1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFRP2Q96HF1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SFRP2Q96HF1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SFRP2Q96HF1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFRP2Q96HF1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFRP2Q96HF1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFRP2Q96HF1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFRP2Q96HF1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFRP2Q96HF1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFRP2Q96HF1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFRP2Q96HF1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFRP2Q96HF1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFRP2Q96HF1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFRP2Q96HF1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFRP2Q96HF1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFRP2Q96HF1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFRP2Q96HF1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFRP2Q96HF1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFRP2Q96HF1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFRP2Q96HF1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFRP2Q96HF1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFRP2Q96HF1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFRP2Q96HF1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFRP2Q96HF1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SFRP2Q96HF1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SFRP2Q96HF1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SFRP2Q96HF1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SFRP2Q96HF1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SFRP2Q96HF1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SFRP2Q96HF1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SFRP2Q96HF1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SFRP2Q96HF1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SFRP2Q96HF1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SFRP2Q96HF1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SFRP2Q96HF1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SFRP2Q96HF1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SFRP2Q96HF1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SFRP2Q96HF1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SFRP2Q96HF1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SFRP2Q96HF1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SFRP2Q96HF1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SFRP2Q96HF1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SFRP2Q96HF1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SFRP2Q96HF1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SFRP2Q96HF1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SFRP2Q96HF1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SFRP2Q96HF1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SFRP2Q96HF1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SFRP2Q96HF1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms