Protein–RNA interactions for Protein: Q96EL3

MRPL53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL53Q96EL3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MRPL53Q96EL3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MRPL53Q96EL3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MRPL53Q96EL3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MRPL53Q96EL3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MRPL53Q96EL3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MRPL53Q96EL3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MRPL53Q96EL3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MRPL53Q96EL3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
MRPL53Q96EL3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MRPL53Q96EL3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MRPL53Q96EL3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MRPL53Q96EL3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MRPL53Q96EL3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MRPL53Q96EL3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MRPL53Q96EL3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MRPL53Q96EL3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MRPL53Q96EL3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MRPL53Q96EL3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MRPL53Q96EL3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MRPL53Q96EL3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MRPL53Q96EL3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
MRPL53Q96EL3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MRPL53Q96EL3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MRPL53Q96EL3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MRPL53Q96EL3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MRPL53Q96EL3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MRPL53Q96EL3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MRPL53Q96EL3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MRPL53Q96EL3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MRPL53Q96EL3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MRPL53Q96EL3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MRPL53Q96EL3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MRPL53Q96EL3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MRPL53Q96EL3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MRPL53Q96EL3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
MRPL53Q96EL3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MRPL53Q96EL3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MRPL53Q96EL3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MRPL53Q96EL3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MRPL53Q96EL3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MRPL53Q96EL3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MRPL53Q96EL3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MRPL53Q96EL3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MRPL53Q96EL3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MRPL53Q96EL3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MRPL53Q96EL3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MRPL53Q96EL3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MRPL53Q96EL3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MRPL53Q96EL3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MRPL53Q96EL3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MRPL53Q96EL3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MRPL53Q96EL3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MRPL53Q96EL3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MRPL53Q96EL3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MRPL53Q96EL3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MRPL53Q96EL3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MRPL53Q96EL3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MRPL53Q96EL3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MRPL53Q96EL3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MRPL53Q96EL3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MRPL53Q96EL3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MRPL53Q96EL3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MRPL53Q96EL3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MRPL53Q96EL3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
MRPL53Q96EL3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MRPL53Q96EL3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MRPL53Q96EL3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MRPL53Q96EL3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MRPL53Q96EL3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MRPL53Q96EL3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MRPL53Q96EL3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MRPL53Q96EL3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MRPL53Q96EL3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MRPL53Q96EL3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MRPL53Q96EL3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MRPL53Q96EL3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MRPL53Q96EL3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPL53Q96EL3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPL53Q96EL3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPL53Q96EL3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPL53Q96EL3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPL53Q96EL3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPL53Q96EL3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPL53Q96EL3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPL53Q96EL3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPL53Q96EL3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPL53Q96EL3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPL53Q96EL3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPL53Q96EL3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPL53Q96EL3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPL53Q96EL3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRPL53Q96EL3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRPL53Q96EL3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRPL53Q96EL3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRPL53Q96EL3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRPL53Q96EL3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRPL53Q96EL3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MRPL53Q96EL3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRPL53Q96EL3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms