Protein–RNA interactions for Protein: Q96EE4

CCDC126, Coiled-coil domain-containing protein 126, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC126Q96EE4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC126Q96EE4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC126Q96EE4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC126Q96EE4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC126Q96EE4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC126Q96EE4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC126Q96EE4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC126Q96EE4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC126Q96EE4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC126Q96EE4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC126Q96EE4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC126Q96EE4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC126Q96EE4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC126Q96EE4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC126Q96EE4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC126Q96EE4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC126Q96EE4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC126Q96EE4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC126Q96EE4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC126Q96EE4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC126Q96EE4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC126Q96EE4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC126Q96EE4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC126Q96EE4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC126Q96EE4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC126Q96EE4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC126Q96EE4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC126Q96EE4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC126Q96EE4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC126Q96EE4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC126Q96EE4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC126Q96EE4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC126Q96EE4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC126Q96EE4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC126Q96EE4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC126Q96EE4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC126Q96EE4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC126Q96EE4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC126Q96EE4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC126Q96EE4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC126Q96EE4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC126Q96EE4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC126Q96EE4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC126Q96EE4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC126Q96EE4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC126Q96EE4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC126Q96EE4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC126Q96EE4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC126Q96EE4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC126Q96EE4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC126Q96EE4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC126Q96EE4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC126Q96EE4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC126Q96EE4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC126Q96EE4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC126Q96EE4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC126Q96EE4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC126Q96EE4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC126Q96EE4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC126Q96EE4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC126Q96EE4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC126Q96EE4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC126Q96EE4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC126Q96EE4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC126Q96EE4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC126Q96EE4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC126Q96EE4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC126Q96EE4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC126Q96EE4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC126Q96EE4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC126Q96EE4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC126Q96EE4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC126Q96EE4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC126Q96EE4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC126Q96EE4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC126Q96EE4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC126Q96EE4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC126Q96EE4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC126Q96EE4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC126Q96EE4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC126Q96EE4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC126Q96EE4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC126Q96EE4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC126Q96EE4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC126Q96EE4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC126Q96EE4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC126Q96EE4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC126Q96EE4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC126Q96EE4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC126Q96EE4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC126Q96EE4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC126Q96EE4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC126Q96EE4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC126Q96EE4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC126Q96EE4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC126Q96EE4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC126Q96EE4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC126Q96EE4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC126Q96EE4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC126Q96EE4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms