Protein–RNA interactions for Protein: Q96DN0

ERP27, Endoplasmic reticulum resident protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERP27Q96DN0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERP27Q96DN0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERP27Q96DN0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERP27Q96DN0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERP27Q96DN0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERP27Q96DN0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERP27Q96DN0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERP27Q96DN0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERP27Q96DN0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERP27Q96DN0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERP27Q96DN0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERP27Q96DN0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERP27Q96DN0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERP27Q96DN0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERP27Q96DN0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERP27Q96DN0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERP27Q96DN0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERP27Q96DN0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERP27Q96DN0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ERP27Q96DN0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERP27Q96DN0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERP27Q96DN0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERP27Q96DN0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERP27Q96DN0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ERP27Q96DN0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERP27Q96DN0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERP27Q96DN0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERP27Q96DN0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ERP27Q96DN0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERP27Q96DN0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERP27Q96DN0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERP27Q96DN0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERP27Q96DN0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERP27Q96DN0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERP27Q96DN0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERP27Q96DN0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERP27Q96DN0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERP27Q96DN0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ERP27Q96DN0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERP27Q96DN0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERP27Q96DN0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERP27Q96DN0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERP27Q96DN0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERP27Q96DN0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERP27Q96DN0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERP27Q96DN0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERP27Q96DN0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERP27Q96DN0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERP27Q96DN0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERP27Q96DN0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERP27Q96DN0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERP27Q96DN0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERP27Q96DN0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERP27Q96DN0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERP27Q96DN0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERP27Q96DN0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERP27Q96DN0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERP27Q96DN0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERP27Q96DN0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERP27Q96DN0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERP27Q96DN0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERP27Q96DN0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERP27Q96DN0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERP27Q96DN0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERP27Q96DN0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERP27Q96DN0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERP27Q96DN0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERP27Q96DN0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERP27Q96DN0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERP27Q96DN0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ERP27Q96DN0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERP27Q96DN0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERP27Q96DN0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ERP27Q96DN0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ERP27Q96DN0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERP27Q96DN0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERP27Q96DN0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERP27Q96DN0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERP27Q96DN0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERP27Q96DN0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERP27Q96DN0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERP27Q96DN0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERP27Q96DN0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERP27Q96DN0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERP27Q96DN0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERP27Q96DN0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERP27Q96DN0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERP27Q96DN0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERP27Q96DN0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERP27Q96DN0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ERP27Q96DN0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERP27Q96DN0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERP27Q96DN0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERP27Q96DN0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERP27Q96DN0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERP27Q96DN0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERP27Q96DN0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERP27Q96DN0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERP27Q96DN0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERP27Q96DN0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms