Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C18orf8Q96DM3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C18orf8Q96DM3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C18orf8Q96DM3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C18orf8Q96DM3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C18orf8Q96DM3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C18orf8Q96DM3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C18orf8Q96DM3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C18orf8Q96DM3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C18orf8Q96DM3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C18orf8Q96DM3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C18orf8Q96DM3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C18orf8Q96DM3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C18orf8Q96DM3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C18orf8Q96DM3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
C18orf8Q96DM3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C18orf8Q96DM3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
C18orf8Q96DM3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C18orf8Q96DM3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C18orf8Q96DM3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C18orf8Q96DM3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C18orf8Q96DM3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C18orf8Q96DM3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C18orf8Q96DM3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C18orf8Q96DM3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C18orf8Q96DM3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C18orf8Q96DM3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C18orf8Q96DM3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C18orf8Q96DM3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C18orf8Q96DM3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C18orf8Q96DM3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C18orf8Q96DM3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C18orf8Q96DM3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C18orf8Q96DM3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C18orf8Q96DM3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C18orf8Q96DM3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C18orf8Q96DM3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C18orf8Q96DM3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
C18orf8Q96DM3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C18orf8Q96DM3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C18orf8Q96DM3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C18orf8Q96DM3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C18orf8Q96DM3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C18orf8Q96DM3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C18orf8Q96DM3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C18orf8Q96DM3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C18orf8Q96DM3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C18orf8Q96DM3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C18orf8Q96DM3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C18orf8Q96DM3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C18orf8Q96DM3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C18orf8Q96DM3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C18orf8Q96DM3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C18orf8Q96DM3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C18orf8Q96DM3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C18orf8Q96DM3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C18orf8Q96DM3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C18orf8Q96DM3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C18orf8Q96DM3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C18orf8Q96DM3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C18orf8Q96DM3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C18orf8Q96DM3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C18orf8Q96DM3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C18orf8Q96DM3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C18orf8Q96DM3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C18orf8Q96DM3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C18orf8Q96DM3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C18orf8Q96DM3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C18orf8Q96DM3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C18orf8Q96DM3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C18orf8Q96DM3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C18orf8Q96DM3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C18orf8Q96DM3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C18orf8Q96DM3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C18orf8Q96DM3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C18orf8Q96DM3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C18orf8Q96DM3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
C18orf8Q96DM3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C18orf8Q96DM3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
C18orf8Q96DM3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C18orf8Q96DM3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C18orf8Q96DM3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C18orf8Q96DM3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C18orf8Q96DM3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C18orf8Q96DM3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C18orf8Q96DM3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C18orf8Q96DM3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C18orf8Q96DM3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
C18orf8Q96DM3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C18orf8Q96DM3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C18orf8Q96DM3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
C18orf8Q96DM3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
C18orf8Q96DM3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C18orf8Q96DM3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C18orf8Q96DM3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C18orf8Q96DM3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C18orf8Q96DM3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
C18orf8Q96DM3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
C18orf8Q96DM3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C18orf8Q96DM3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.1 ms