Protein–RNA interactions for Protein: Q96DE9

CXorf40B, Protein CXorf40B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXorf40BQ96DE9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXorf40BQ96DE9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXorf40BQ96DE9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXorf40BQ96DE9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXorf40BQ96DE9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXorf40BQ96DE9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXorf40BQ96DE9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXorf40BQ96DE9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXorf40BQ96DE9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CXorf40BQ96DE9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXorf40BQ96DE9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXorf40BQ96DE9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXorf40BQ96DE9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXorf40BQ96DE9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXorf40BQ96DE9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXorf40BQ96DE9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXorf40BQ96DE9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXorf40BQ96DE9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXorf40BQ96DE9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXorf40BQ96DE9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXorf40BQ96DE9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXorf40BQ96DE9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXorf40BQ96DE9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXorf40BQ96DE9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXorf40BQ96DE9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXorf40BQ96DE9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXorf40BQ96DE9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXorf40BQ96DE9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXorf40BQ96DE9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXorf40BQ96DE9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXorf40BQ96DE9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXorf40BQ96DE9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXorf40BQ96DE9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXorf40BQ96DE9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXorf40BQ96DE9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXorf40BQ96DE9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXorf40BQ96DE9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXorf40BQ96DE9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXorf40BQ96DE9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXorf40BQ96DE9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CXorf40BQ96DE9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXorf40BQ96DE9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXorf40BQ96DE9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXorf40BQ96DE9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXorf40BQ96DE9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXorf40BQ96DE9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXorf40BQ96DE9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CXorf40BQ96DE9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXorf40BQ96DE9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXorf40BQ96DE9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXorf40BQ96DE9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXorf40BQ96DE9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXorf40BQ96DE9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXorf40BQ96DE9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXorf40BQ96DE9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXorf40BQ96DE9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXorf40BQ96DE9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXorf40BQ96DE9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXorf40BQ96DE9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXorf40BQ96DE9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXorf40BQ96DE9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXorf40BQ96DE9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXorf40BQ96DE9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXorf40BQ96DE9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXorf40BQ96DE9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXorf40BQ96DE9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXorf40BQ96DE9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXorf40BQ96DE9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CXorf40BQ96DE9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CXorf40BQ96DE9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CXorf40BQ96DE9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CXorf40BQ96DE9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CXorf40BQ96DE9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CXorf40BQ96DE9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CXorf40BQ96DE9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CXorf40BQ96DE9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CXorf40BQ96DE9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CXorf40BQ96DE9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CXorf40BQ96DE9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CXorf40BQ96DE9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CXorf40BQ96DE9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CXorf40BQ96DE9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CXorf40BQ96DE9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CXorf40BQ96DE9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CXorf40BQ96DE9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CXorf40BQ96DE9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CXorf40BQ96DE9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CXorf40BQ96DE9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CXorf40BQ96DE9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CXorf40BQ96DE9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXorf40BQ96DE9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXorf40BQ96DE9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXorf40BQ96DE9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXorf40BQ96DE9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CXorf40BQ96DE9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXorf40BQ96DE9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXorf40BQ96DE9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXorf40BQ96DE9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXorf40BQ96DE9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CXorf40BQ96DE9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms