Protein–RNA interactions for Protein: Q96CP7

TLCD1, Calfacilitin, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLCD1Q96CP7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TLCD1Q96CP7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TLCD1Q96CP7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TLCD1Q96CP7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TLCD1Q96CP7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TLCD1Q96CP7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TLCD1Q96CP7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TLCD1Q96CP7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TLCD1Q96CP7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TLCD1Q96CP7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TLCD1Q96CP7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TLCD1Q96CP7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TLCD1Q96CP7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TLCD1Q96CP7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TLCD1Q96CP7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TLCD1Q96CP7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TLCD1Q96CP7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TLCD1Q96CP7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TLCD1Q96CP7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TLCD1Q96CP7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TLCD1Q96CP7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TLCD1Q96CP7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TLCD1Q96CP7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TLCD1Q96CP7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TLCD1Q96CP7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TLCD1Q96CP7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TLCD1Q96CP7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TLCD1Q96CP7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TLCD1Q96CP7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TLCD1Q96CP7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TLCD1Q96CP7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TLCD1Q96CP7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TLCD1Q96CP7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TLCD1Q96CP7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TLCD1Q96CP7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TLCD1Q96CP7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TLCD1Q96CP7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TLCD1Q96CP7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TLCD1Q96CP7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TLCD1Q96CP7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TLCD1Q96CP7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TLCD1Q96CP7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TLCD1Q96CP7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TLCD1Q96CP7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TLCD1Q96CP7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TLCD1Q96CP7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TLCD1Q96CP7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TLCD1Q96CP7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TLCD1Q96CP7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TLCD1Q96CP7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TLCD1Q96CP7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TLCD1Q96CP7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TLCD1Q96CP7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TLCD1Q96CP7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TLCD1Q96CP7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TLCD1Q96CP7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TLCD1Q96CP7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
TLCD1Q96CP7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TLCD1Q96CP7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TLCD1Q96CP7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TLCD1Q96CP7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TLCD1Q96CP7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TLCD1Q96CP7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TLCD1Q96CP7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TLCD1Q96CP7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TLCD1Q96CP7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TLCD1Q96CP7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TLCD1Q96CP7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TLCD1Q96CP7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TLCD1Q96CP7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TLCD1Q96CP7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TLCD1Q96CP7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TLCD1Q96CP7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TLCD1Q96CP7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TLCD1Q96CP7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TLCD1Q96CP7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TLCD1Q96CP7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TLCD1Q96CP7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TLCD1Q96CP7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TLCD1Q96CP7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TLCD1Q96CP7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TLCD1Q96CP7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TLCD1Q96CP7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TLCD1Q96CP7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TLCD1Q96CP7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TLCD1Q96CP7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TLCD1Q96CP7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TLCD1Q96CP7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TLCD1Q96CP7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TLCD1Q96CP7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TLCD1Q96CP7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TLCD1Q96CP7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TLCD1Q96CP7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TLCD1Q96CP7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TLCD1Q96CP7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TLCD1Q96CP7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TLCD1Q96CP7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TLCD1Q96CP7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TLCD1Q96CP7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TLCD1Q96CP7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms