Protein–RNA interactions for Protein: Q96CJ1

EAF2, ELL-associated factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF2Q96CJ1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
EAF2Q96CJ1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
EAF2Q96CJ1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
EAF2Q96CJ1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
EAF2Q96CJ1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EAF2Q96CJ1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EAF2Q96CJ1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EAF2Q96CJ1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
EAF2Q96CJ1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EAF2Q96CJ1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EAF2Q96CJ1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EAF2Q96CJ1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EAF2Q96CJ1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EAF2Q96CJ1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EAF2Q96CJ1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
EAF2Q96CJ1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
EAF2Q96CJ1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EAF2Q96CJ1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EAF2Q96CJ1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EAF2Q96CJ1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EAF2Q96CJ1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
EAF2Q96CJ1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EAF2Q96CJ1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EAF2Q96CJ1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
EAF2Q96CJ1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EAF2Q96CJ1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
EAF2Q96CJ1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
EAF2Q96CJ1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
EAF2Q96CJ1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
EAF2Q96CJ1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EAF2Q96CJ1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
EAF2Q96CJ1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
EAF2Q96CJ1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EAF2Q96CJ1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EAF2Q96CJ1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
EAF2Q96CJ1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EAF2Q96CJ1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EAF2Q96CJ1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
EAF2Q96CJ1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EAF2Q96CJ1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EAF2Q96CJ1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EAF2Q96CJ1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
EAF2Q96CJ1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
EAF2Q96CJ1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
EAF2Q96CJ1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
EAF2Q96CJ1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
EAF2Q96CJ1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
EAF2Q96CJ1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
EAF2Q96CJ1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
EAF2Q96CJ1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
EAF2Q96CJ1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
EAF2Q96CJ1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
EAF2Q96CJ1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
EAF2Q96CJ1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
EAF2Q96CJ1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EAF2Q96CJ1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
EAF2Q96CJ1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
EAF2Q96CJ1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
EAF2Q96CJ1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
EAF2Q96CJ1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
EAF2Q96CJ1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EAF2Q96CJ1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
EAF2Q96CJ1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
EAF2Q96CJ1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
EAF2Q96CJ1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EAF2Q96CJ1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EAF2Q96CJ1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EAF2Q96CJ1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EAF2Q96CJ1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EAF2Q96CJ1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EAF2Q96CJ1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
EAF2Q96CJ1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EAF2Q96CJ1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EAF2Q96CJ1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EAF2Q96CJ1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EAF2Q96CJ1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EAF2Q96CJ1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
EAF2Q96CJ1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EAF2Q96CJ1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EAF2Q96CJ1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
EAF2Q96CJ1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
EAF2Q96CJ1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EAF2Q96CJ1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EAF2Q96CJ1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EAF2Q96CJ1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EAF2Q96CJ1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EAF2Q96CJ1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EAF2Q96CJ1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EAF2Q96CJ1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EAF2Q96CJ1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
EAF2Q96CJ1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
EAF2Q96CJ1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
EAF2Q96CJ1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EAF2Q96CJ1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EAF2Q96CJ1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EAF2Q96CJ1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EAF2Q96CJ1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EAF2Q96CJ1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EAF2Q96CJ1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EAF2Q96CJ1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms