Protein–RNA interactions for Protein: Q96A61

TRIM52, Tripartite motif-containing protein 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM52Q96A61 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
TRIM52Q96A61 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
TRIM52Q96A61 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
TRIM52Q96A61 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
TRIM52Q96A61 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
TRIM52Q96A61 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
TRIM52Q96A61 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
TRIM52Q96A61 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
TRIM52Q96A61 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
TRIM52Q96A61 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
TRIM52Q96A61 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
TRIM52Q96A61 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
TRIM52Q96A61 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
TRIM52Q96A61 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
TRIM52Q96A61 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
TRIM52Q96A61 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
TRIM52Q96A61 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
TRIM52Q96A61 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
TRIM52Q96A61 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
TRIM52Q96A61 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
TRIM52Q96A61 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
TRIM52Q96A61 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
TRIM52Q96A61 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
TRIM52Q96A61 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
TRIM52Q96A61 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
TRIM52Q96A61 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
TRIM52Q96A61 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC34.15■■■■□ 3.06
TRIM52Q96A61 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
TRIM52Q96A61 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
TRIM52Q96A61 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
TRIM52Q96A61 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
TRIM52Q96A61 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
TRIM52Q96A61 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
TRIM52Q96A61 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
TRIM52Q96A61 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
TRIM52Q96A61 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
TRIM52Q96A61 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
TRIM52Q96A61 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
TRIM52Q96A61 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
TRIM52Q96A61 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
TRIM52Q96A61 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
TRIM52Q96A61 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
TRIM52Q96A61 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
TRIM52Q96A61 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
TRIM52Q96A61 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC34.13■■■■□ 3.05
TRIM52Q96A61 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
TRIM52Q96A61 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
TRIM52Q96A61 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
TRIM52Q96A61 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
TRIM52Q96A61 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TRIM52Q96A61 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TRIM52Q96A61 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TRIM52Q96A61 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
TRIM52Q96A61 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TRIM52Q96A61 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
TRIM52Q96A61 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TRIM52Q96A61 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
TRIM52Q96A61 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
TRIM52Q96A61 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
TRIM52Q96A61 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
TRIM52Q96A61 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
TRIM52Q96A61 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC34.11■■■■□ 3.05
TRIM52Q96A61 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
TRIM52Q96A61 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
TRIM52Q96A61 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
TRIM52Q96A61 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
TRIM52Q96A61 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
TRIM52Q96A61 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
TRIM52Q96A61 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
TRIM52Q96A61 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
TRIM52Q96A61 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
TRIM52Q96A61 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
TRIM52Q96A61 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
TRIM52Q96A61 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
TRIM52Q96A61 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
TRIM52Q96A61 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
TRIM52Q96A61 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
TRIM52Q96A61 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
TRIM52Q96A61 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
TRIM52Q96A61 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
TRIM52Q96A61 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
TRIM52Q96A61 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
TRIM52Q96A61 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
TRIM52Q96A61 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
TRIM52Q96A61 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
TRIM52Q96A61 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
TRIM52Q96A61 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
TRIM52Q96A61 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
TRIM52Q96A61 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
TRIM52Q96A61 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
TRIM52Q96A61 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
TRIM52Q96A61 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
TRIM52Q96A61 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
TRIM52Q96A61 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
TRIM52Q96A61 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
TRIM52Q96A61 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
TRIM52Q96A61 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
TRIM52Q96A61 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
TRIM52Q96A61 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC34.06■■■■□ 3.04
TRIM52Q96A61 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms