Protein–RNA interactions for Protein: Q969V3

NCLN, Nicalin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLNQ969V3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCLNQ969V3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCLNQ969V3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCLNQ969V3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCLNQ969V3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCLNQ969V3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCLNQ969V3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCLNQ969V3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCLNQ969V3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCLNQ969V3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCLNQ969V3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCLNQ969V3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCLNQ969V3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NCLNQ969V3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCLNQ969V3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCLNQ969V3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCLNQ969V3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCLNQ969V3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCLNQ969V3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCLNQ969V3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCLNQ969V3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCLNQ969V3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCLNQ969V3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCLNQ969V3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCLNQ969V3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCLNQ969V3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCLNQ969V3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCLNQ969V3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCLNQ969V3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCLNQ969V3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCLNQ969V3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCLNQ969V3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCLNQ969V3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCLNQ969V3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCLNQ969V3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCLNQ969V3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCLNQ969V3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCLNQ969V3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCLNQ969V3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCLNQ969V3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCLNQ969V3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCLNQ969V3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCLNQ969V3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCLNQ969V3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCLNQ969V3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCLNQ969V3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCLNQ969V3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCLNQ969V3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCLNQ969V3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCLNQ969V3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCLNQ969V3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCLNQ969V3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCLNQ969V3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCLNQ969V3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCLNQ969V3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCLNQ969V3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCLNQ969V3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NCLNQ969V3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NCLNQ969V3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NCLNQ969V3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NCLNQ969V3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NCLNQ969V3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NCLNQ969V3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCLNQ969V3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCLNQ969V3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCLNQ969V3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCLNQ969V3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCLNQ969V3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NCLNQ969V3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCLNQ969V3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCLNQ969V3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCLNQ969V3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCLNQ969V3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCLNQ969V3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCLNQ969V3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCLNQ969V3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCLNQ969V3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCLNQ969V3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCLNQ969V3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCLNQ969V3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCLNQ969V3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCLNQ969V3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NCLNQ969V3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCLNQ969V3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCLNQ969V3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCLNQ969V3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCLNQ969V3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCLNQ969V3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCLNQ969V3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCLNQ969V3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NCLNQ969V3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCLNQ969V3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCLNQ969V3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NCLNQ969V3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCLNQ969V3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCLNQ969V3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCLNQ969V3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCLNQ969V3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCLNQ969V3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCLNQ969V3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms