Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SNX21Q969T3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SNX21Q969T3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SNX21Q969T3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SNX21Q969T3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SNX21Q969T3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SNX21Q969T3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SNX21Q969T3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SNX21Q969T3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SNX21Q969T3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SNX21Q969T3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SNX21Q969T3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SNX21Q969T3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SNX21Q969T3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SNX21Q969T3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SNX21Q969T3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNX21Q969T3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNX21Q969T3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNX21Q969T3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNX21Q969T3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNX21Q969T3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNX21Q969T3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNX21Q969T3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SNX21Q969T3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNX21Q969T3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNX21Q969T3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNX21Q969T3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNX21Q969T3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNX21Q969T3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNX21Q969T3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNX21Q969T3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNX21Q969T3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNX21Q969T3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNX21Q969T3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNX21Q969T3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNX21Q969T3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNX21Q969T3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNX21Q969T3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SNX21Q969T3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNX21Q969T3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNX21Q969T3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNX21Q969T3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNX21Q969T3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNX21Q969T3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNX21Q969T3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNX21Q969T3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNX21Q969T3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SNX21Q969T3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SNX21Q969T3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SNX21Q969T3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SNX21Q969T3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SNX21Q969T3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SNX21Q969T3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SNX21Q969T3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SNX21Q969T3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SNX21Q969T3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SNX21Q969T3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SNX21Q969T3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SNX21Q969T3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
SNX21Q969T3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNX21Q969T3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNX21Q969T3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNX21Q969T3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNX21Q969T3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNX21Q969T3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNX21Q969T3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SNX21Q969T3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNX21Q969T3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNX21Q969T3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNX21Q969T3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNX21Q969T3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNX21Q969T3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNX21Q969T3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNX21Q969T3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNX21Q969T3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNX21Q969T3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNX21Q969T3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNX21Q969T3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNX21Q969T3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNX21Q969T3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNX21Q969T3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNX21Q969T3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNX21Q969T3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNX21Q969T3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNX21Q969T3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNX21Q969T3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNX21Q969T3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SNX21Q969T3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNX21Q969T3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNX21Q969T3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNX21Q969T3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNX21Q969T3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNX21Q969T3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNX21Q969T3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SNX21Q969T3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNX21Q969T3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNX21Q969T3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNX21Q969T3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNX21Q969T3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNX21Q969T3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms