Protein–RNA interactions for Protein: Q92890

UFD1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFD1Q92890 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UFD1Q92890 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UFD1Q92890 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UFD1Q92890 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UFD1Q92890 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UFD1Q92890 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UFD1Q92890 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UFD1Q92890 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UFD1Q92890 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UFD1Q92890 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UFD1Q92890 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UFD1Q92890 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UFD1Q92890 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UFD1Q92890 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
UFD1Q92890 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UFD1Q92890 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UFD1Q92890 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UFD1Q92890 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UFD1Q92890 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UFD1Q92890 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UFD1Q92890 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UFD1Q92890 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UFD1Q92890 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UFD1Q92890 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UFD1Q92890 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UFD1Q92890 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UFD1Q92890 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UFD1Q92890 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UFD1Q92890 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UFD1Q92890 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UFD1Q92890 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UFD1Q92890 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
UFD1Q92890 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UFD1Q92890 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UFD1Q92890 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UFD1Q92890 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UFD1Q92890 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
UFD1Q92890 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UFD1Q92890 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UFD1Q92890 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UFD1Q92890 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UFD1Q92890 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UFD1Q92890 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UFD1Q92890 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UFD1Q92890 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UFD1Q92890 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UFD1Q92890 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UFD1Q92890 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UFD1Q92890 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UFD1Q92890 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UFD1Q92890 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UFD1Q92890 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UFD1Q92890 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UFD1Q92890 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UFD1Q92890 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
UFD1Q92890 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UFD1Q92890 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UFD1Q92890 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UFD1Q92890 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
UFD1Q92890 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UFD1Q92890 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UFD1Q92890 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UFD1Q92890 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UFD1Q92890 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
UFD1Q92890 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UFD1Q92890 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UFD1Q92890 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UFD1Q92890 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UFD1Q92890 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UFD1Q92890 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
UFD1Q92890 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
UFD1Q92890 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
UFD1Q92890 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
UFD1Q92890 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UFD1Q92890 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UFD1Q92890 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UFD1Q92890 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UFD1Q92890 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UFD1Q92890 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UFD1Q92890 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UFD1Q92890 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UFD1Q92890 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UFD1Q92890 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UFD1Q92890 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UFD1Q92890 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UFD1Q92890 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UFD1Q92890 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UFD1Q92890 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UFD1Q92890 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UFD1Q92890 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
UFD1Q92890 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UFD1Q92890 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UFD1Q92890 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UFD1Q92890 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UFD1Q92890 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
UFD1Q92890 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UFD1Q92890 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UFD1Q92890 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UFD1Q92890 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UFD1Q92890 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms