Protein–RNA interactions for Protein: Q92845

KIFAP3, Kinesin-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFAP3Q92845 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KIFAP3Q92845 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KIFAP3Q92845 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KIFAP3Q92845 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KIFAP3Q92845 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KIFAP3Q92845 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KIFAP3Q92845 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KIFAP3Q92845 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KIFAP3Q92845 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
KIFAP3Q92845 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
KIFAP3Q92845 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KIFAP3Q92845 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KIFAP3Q92845 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KIFAP3Q92845 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KIFAP3Q92845 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KIFAP3Q92845 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KIFAP3Q92845 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KIFAP3Q92845 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KIFAP3Q92845 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KIFAP3Q92845 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
KIFAP3Q92845 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
KIFAP3Q92845 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KIFAP3Q92845 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KIFAP3Q92845 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KIFAP3Q92845 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KIFAP3Q92845 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KIFAP3Q92845 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
KIFAP3Q92845 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KIFAP3Q92845 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KIFAP3Q92845 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KIFAP3Q92845 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KIFAP3Q92845 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KIFAP3Q92845 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KIFAP3Q92845 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KIFAP3Q92845 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KIFAP3Q92845 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KIFAP3Q92845 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KIFAP3Q92845 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KIFAP3Q92845 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KIFAP3Q92845 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
KIFAP3Q92845 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KIFAP3Q92845 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KIFAP3Q92845 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KIFAP3Q92845 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KIFAP3Q92845 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KIFAP3Q92845 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
KIFAP3Q92845 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KIFAP3Q92845 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KIFAP3Q92845 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KIFAP3Q92845 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KIFAP3Q92845 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KIFAP3Q92845 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KIFAP3Q92845 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KIFAP3Q92845 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KIFAP3Q92845 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KIFAP3Q92845 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KIFAP3Q92845 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KIFAP3Q92845 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KIFAP3Q92845 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KIFAP3Q92845 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KIFAP3Q92845 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KIFAP3Q92845 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KIFAP3Q92845 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KIFAP3Q92845 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KIFAP3Q92845 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KIFAP3Q92845 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
KIFAP3Q92845 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KIFAP3Q92845 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KIFAP3Q92845 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KIFAP3Q92845 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KIFAP3Q92845 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KIFAP3Q92845 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KIFAP3Q92845 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KIFAP3Q92845 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KIFAP3Q92845 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KIFAP3Q92845 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KIFAP3Q92845 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KIFAP3Q92845 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KIFAP3Q92845 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KIFAP3Q92845 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
KIFAP3Q92845 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
KIFAP3Q92845 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KIFAP3Q92845 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KIFAP3Q92845 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
KIFAP3Q92845 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KIFAP3Q92845 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
KIFAP3Q92845 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
KIFAP3Q92845 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
KIFAP3Q92845 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
KIFAP3Q92845 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
KIFAP3Q92845 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KIFAP3Q92845 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KIFAP3Q92845 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KIFAP3Q92845 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KIFAP3Q92845 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KIFAP3Q92845 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KIFAP3Q92845 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KIFAP3Q92845 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KIFAP3Q92845 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KIFAP3Q92845 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms