Protein–RNA interactions for Protein: Q92752

TNR, Tenascin-R, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRQ92752 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
TNRQ92752 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC33.7■■■□□ 2.98
TNRQ92752 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
TNRQ92752 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC33.7■■■□□ 2.98
TNRQ92752 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC33.7■■■□□ 2.98
TNRQ92752 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC33.7■■■□□ 2.98
TNRQ92752 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC33.7■■■□□ 2.98
TNRQ92752 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC33.7■■■□□ 2.98
TNRQ92752 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC33.7■■■□□ 2.98
TNRQ92752 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TNRQ92752 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TNRQ92752 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TNRQ92752 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TNRQ92752 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TNRQ92752 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
TNRQ92752 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
TNRQ92752 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
TNRQ92752 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
TNRQ92752 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
TNRQ92752 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
TNRQ92752 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
TNRQ92752 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
TNRQ92752 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
TNRQ92752 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
TNRQ92752 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
TNRQ92752 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
TNRQ92752 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC33.65■■■□□ 2.98
TNRQ92752 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.65■■■□□ 2.98
TNRQ92752 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
TNRQ92752 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
TNRQ92752 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
TNRQ92752 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
TNRQ92752 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
TNRQ92752 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
TNRQ92752 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
TNRQ92752 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
TNRQ92752 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
TNRQ92752 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
TNRQ92752 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
TNRQ92752 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
TNRQ92752 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
TNRQ92752 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
TNRQ92752 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
TNRQ92752 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
TNRQ92752 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
TNRQ92752 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
TNRQ92752 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
TNRQ92752 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
TNRQ92752 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
TNRQ92752 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
TNRQ92752 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
TNRQ92752 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
TNRQ92752 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
TNRQ92752 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC33.61■■■□□ 2.97
TNRQ92752 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
TNRQ92752 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
TNRQ92752 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
TNRQ92752 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
TNRQ92752 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
TNRQ92752 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
TNRQ92752 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC33.6■■■□□ 2.97
TNRQ92752 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
TNRQ92752 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
TNRQ92752 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
TNRQ92752 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
TNRQ92752 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
TNRQ92752 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
TNRQ92752 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
TNRQ92752 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
TNRQ92752 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC33.6■■■□□ 2.97
TNRQ92752 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
TNRQ92752 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
TNRQ92752 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
TNRQ92752 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
TNRQ92752 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
TNRQ92752 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
TNRQ92752 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
TNRQ92752 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
TNRQ92752 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
TNRQ92752 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
TNRQ92752 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
TNRQ92752 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
TNRQ92752 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
TNRQ92752 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
TNRQ92752 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
TNRQ92752 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
TNRQ92752 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
TNRQ92752 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
TNRQ92752 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
TNRQ92752 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
TNRQ92752 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
TNRQ92752 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TNRQ92752 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
TNRQ92752 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
TNRQ92752 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TNRQ92752 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
TNRQ92752 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
TNRQ92752 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
TNRQ92752 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
TNRQ92752 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms