Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVP7

LMBR1, Limb region 1 protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1Q8WVP7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMBR1Q8WVP7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMBR1Q8WVP7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMBR1Q8WVP7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
LMBR1Q8WVP7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMBR1Q8WVP7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMBR1Q8WVP7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMBR1Q8WVP7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMBR1Q8WVP7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMBR1Q8WVP7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMBR1Q8WVP7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMBR1Q8WVP7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMBR1Q8WVP7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMBR1Q8WVP7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMBR1Q8WVP7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMBR1Q8WVP7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMBR1Q8WVP7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMBR1Q8WVP7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMBR1Q8WVP7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMBR1Q8WVP7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMBR1Q8WVP7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMBR1Q8WVP7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMBR1Q8WVP7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMBR1Q8WVP7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMBR1Q8WVP7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMBR1Q8WVP7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMBR1Q8WVP7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMBR1Q8WVP7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMBR1Q8WVP7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
LMBR1Q8WVP7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMBR1Q8WVP7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMBR1Q8WVP7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMBR1Q8WVP7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMBR1Q8WVP7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMBR1Q8WVP7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
LMBR1Q8WVP7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMBR1Q8WVP7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMBR1Q8WVP7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMBR1Q8WVP7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMBR1Q8WVP7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMBR1Q8WVP7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMBR1Q8WVP7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMBR1Q8WVP7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMBR1Q8WVP7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMBR1Q8WVP7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMBR1Q8WVP7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMBR1Q8WVP7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMBR1Q8WVP7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMBR1Q8WVP7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMBR1Q8WVP7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMBR1Q8WVP7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LMBR1Q8WVP7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMBR1Q8WVP7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMBR1Q8WVP7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMBR1Q8WVP7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMBR1Q8WVP7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMBR1Q8WVP7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMBR1Q8WVP7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMBR1Q8WVP7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMBR1Q8WVP7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMBR1Q8WVP7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
LMBR1Q8WVP7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMBR1Q8WVP7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMBR1Q8WVP7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMBR1Q8WVP7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LMBR1Q8WVP7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
LMBR1Q8WVP7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LMBR1Q8WVP7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMBR1Q8WVP7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMBR1Q8WVP7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMBR1Q8WVP7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMBR1Q8WVP7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMBR1Q8WVP7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMBR1Q8WVP7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMBR1Q8WVP7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMBR1Q8WVP7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMBR1Q8WVP7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMBR1Q8WVP7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMBR1Q8WVP7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMBR1Q8WVP7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMBR1Q8WVP7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMBR1Q8WVP7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMBR1Q8WVP7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMBR1Q8WVP7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMBR1Q8WVP7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMBR1Q8WVP7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
LMBR1Q8WVP7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMBR1Q8WVP7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
LMBR1Q8WVP7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMBR1Q8WVP7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
LMBR1Q8WVP7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMBR1Q8WVP7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMBR1Q8WVP7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMBR1Q8WVP7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMBR1Q8WVP7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMBR1Q8WVP7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMBR1Q8WVP7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMBR1Q8WVP7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMBR1Q8WVP7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMBR1Q8WVP7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms