Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY2

RB1CC1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RB1CC1Q8TDY2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC45.07■■■■■ 4.8
RB1CC1Q8TDY2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC45.05■■■■■ 4.8
RB1CC1Q8TDY2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.05■■■■■ 4.8
RB1CC1Q8TDY2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC45.05■■■■■ 4.8
RB1CC1Q8TDY2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC45.05■■■■■ 4.8
RB1CC1Q8TDY2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC45.04■■■■■ 4.8
RB1CC1Q8TDY2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC45.03■■■■■ 4.8
RB1CC1Q8TDY2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC45.03■■■■■ 4.8
RB1CC1Q8TDY2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC45.03■■■■■ 4.8
RB1CC1Q8TDY2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
RB1CC1Q8TDY2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
RB1CC1Q8TDY2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.02■■■■■ 4.8
RB1CC1Q8TDY2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC45.02■■■■■ 4.8
RB1CC1Q8TDY2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC45.02■■■■■ 4.8
RB1CC1Q8TDY2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.02■■■■■ 4.8
RB1CC1Q8TDY2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
RB1CC1Q8TDY2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
RB1CC1Q8TDY2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.01■■■■■ 4.8
RB1CC1Q8TDY2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC45.01■■■■■ 4.8
RB1CC1Q8TDY2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC45.01■■■■■ 4.8
RB1CC1Q8TDY2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45■■■■■ 4.79
RB1CC1Q8TDY2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45■■■■■ 4.79
RB1CC1Q8TDY2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45■■■■■ 4.79
RB1CC1Q8TDY2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45■■■■■ 4.79
RB1CC1Q8TDY2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
RB1CC1Q8TDY2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC44.99■■■■■ 4.79
RB1CC1Q8TDY2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC44.99■■■■■ 4.79
RB1CC1Q8TDY2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC44.99■■■■■ 4.79
RB1CC1Q8TDY2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
RB1CC1Q8TDY2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
RB1CC1Q8TDY2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
RB1CC1Q8TDY2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC44.99■■■■■ 4.79
RB1CC1Q8TDY2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.98■■■■■ 4.79
RB1CC1Q8TDY2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC44.97■■■■■ 4.79
RB1CC1Q8TDY2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC44.97■■■■■ 4.79
RB1CC1Q8TDY2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.97■■■■■ 4.79
RB1CC1Q8TDY2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC44.97■■■■■ 4.79
RB1CC1Q8TDY2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.97■■■■■ 4.79
RB1CC1Q8TDY2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.96■■■■■ 4.79
RB1CC1Q8TDY2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC44.96■■■■■ 4.79
RB1CC1Q8TDY2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC44.96■■■■■ 4.79
RB1CC1Q8TDY2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.96■■■■■ 4.79
RB1CC1Q8TDY2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC44.96■■■■■ 4.79
RB1CC1Q8TDY2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC44.95■■■■■ 4.79
RB1CC1Q8TDY2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC44.95■■■■■ 4.79
RB1CC1Q8TDY2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.95■■■■■ 4.79
RB1CC1Q8TDY2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.78
RB1CC1Q8TDY2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.78
RB1CC1Q8TDY2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.78
RB1CC1Q8TDY2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC44.94■■■■■ 4.78
RB1CC1Q8TDY2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC44.93■■■■■ 4.78
RB1CC1Q8TDY2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.93■■■■■ 4.78
RB1CC1Q8TDY2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC44.93■■■■■ 4.78
RB1CC1Q8TDY2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC44.93■■■■■ 4.78
RB1CC1Q8TDY2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC44.93■■■■■ 4.78
RB1CC1Q8TDY2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
RB1CC1Q8TDY2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
RB1CC1Q8TDY2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC44.92■■■■■ 4.78
RB1CC1Q8TDY2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC44.91■■■■■ 4.78
RB1CC1Q8TDY2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.91■■■■■ 4.78
RB1CC1Q8TDY2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.9■■■■■ 4.78
RB1CC1Q8TDY2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC44.9■■■■■ 4.78
RB1CC1Q8TDY2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC44.89■■■■■ 4.78
RB1CC1Q8TDY2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC44.89■■■■■ 4.78
RB1CC1Q8TDY2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC44.89■■■■■ 4.78
RB1CC1Q8TDY2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.89■■■■■ 4.78
RB1CC1Q8TDY2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.89■■■■■ 4.78
RB1CC1Q8TDY2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.89■■■■■ 4.78
RB1CC1Q8TDY2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC44.89■■■■■ 4.78
RB1CC1Q8TDY2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC44.89■■■■■ 4.78
RB1CC1Q8TDY2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.89■■■■■ 4.78
RB1CC1Q8TDY2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.89■■■■■ 4.78
RB1CC1Q8TDY2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.78
RB1CC1Q8TDY2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC44.88■■■■■ 4.78
RB1CC1Q8TDY2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC44.88■■■■■ 4.78
RB1CC1Q8TDY2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC44.88■■■■■ 4.77
RB1CC1Q8TDY2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC44.87■■■■■ 4.77
RB1CC1Q8TDY2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC44.87■■■■■ 4.77
RB1CC1Q8TDY2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC44.87■■■■■ 4.77
RB1CC1Q8TDY2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.87■■■■■ 4.77
RB1CC1Q8TDY2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC44.86■■■■■ 4.77
RB1CC1Q8TDY2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC44.86■■■■■ 4.77
RB1CC1Q8TDY2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC44.86■■■■■ 4.77
RB1CC1Q8TDY2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC44.86■■■■■ 4.77
RB1CC1Q8TDY2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC44.86■■■■■ 4.77
RB1CC1Q8TDY2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.85■■■■■ 4.77
RB1CC1Q8TDY2 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC44.85■■■■■ 4.77
RB1CC1Q8TDY2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.85■■■■■ 4.77
RB1CC1Q8TDY2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC44.84■■■■■ 4.77
RB1CC1Q8TDY2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC44.84■■■■■ 4.77
RB1CC1Q8TDY2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
RB1CC1Q8TDY2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC44.83■■■■■ 4.77
RB1CC1Q8TDY2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
RB1CC1Q8TDY2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC44.83■■■■■ 4.77
RB1CC1Q8TDY2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
RB1CC1Q8TDY2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC44.82■■■■■ 4.77
RB1CC1Q8TDY2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC44.82■■■■■ 4.77
RB1CC1Q8TDY2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.82■■■■■ 4.77
RB1CC1Q8TDY2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.81■■■■■ 4.76
RB1CC1Q8TDY2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC44.8■■■■■ 4.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms