Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HELBQ8NG08 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HELBQ8NG08 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HELBQ8NG08 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
HELBQ8NG08 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HELBQ8NG08 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
HELBQ8NG08 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HELBQ8NG08 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HELBQ8NG08 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HELBQ8NG08 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HELBQ8NG08 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HELBQ8NG08 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HELBQ8NG08 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HELBQ8NG08 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HELBQ8NG08 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HELBQ8NG08 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HELBQ8NG08 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HELBQ8NG08 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HELBQ8NG08 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HELBQ8NG08 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HELBQ8NG08 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HELBQ8NG08 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HELBQ8NG08 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HELBQ8NG08 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HELBQ8NG08 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HELBQ8NG08 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HELBQ8NG08 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
HELBQ8NG08 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HELBQ8NG08 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HELBQ8NG08 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HELBQ8NG08 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HELBQ8NG08 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
HELBQ8NG08 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HELBQ8NG08 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HELBQ8NG08 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HELBQ8NG08 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HELBQ8NG08 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HELBQ8NG08 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HELBQ8NG08 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HELBQ8NG08 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HELBQ8NG08 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
HELBQ8NG08 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HELBQ8NG08 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HELBQ8NG08 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HELBQ8NG08 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HELBQ8NG08 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HELBQ8NG08 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HELBQ8NG08 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HELBQ8NG08 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HELBQ8NG08 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
HELBQ8NG08 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HELBQ8NG08 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
HELBQ8NG08 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HELBQ8NG08 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HELBQ8NG08 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HELBQ8NG08 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HELBQ8NG08 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HELBQ8NG08 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HELBQ8NG08 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HELBQ8NG08 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HELBQ8NG08 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HELBQ8NG08 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HELBQ8NG08 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HELBQ8NG08 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HELBQ8NG08 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HELBQ8NG08 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HELBQ8NG08 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HELBQ8NG08 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HELBQ8NG08 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HELBQ8NG08 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HELBQ8NG08 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HELBQ8NG08 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HELBQ8NG08 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HELBQ8NG08 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HELBQ8NG08 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
HELBQ8NG08 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
HELBQ8NG08 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HELBQ8NG08 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HELBQ8NG08 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HELBQ8NG08 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HELBQ8NG08 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HELBQ8NG08 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HELBQ8NG08 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HELBQ8NG08 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HELBQ8NG08 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
HELBQ8NG08 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
HELBQ8NG08 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HELBQ8NG08 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HELBQ8NG08 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HELBQ8NG08 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HELBQ8NG08 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HELBQ8NG08 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
HELBQ8NG08 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HELBQ8NG08 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HELBQ8NG08 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HELBQ8NG08 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HELBQ8NG08 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HELBQ8NG08 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HELBQ8NG08 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HELBQ8NG08 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms