Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND04

SMG8, Protein SMG8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG8Q8ND04 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMG8Q8ND04 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMG8Q8ND04 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SMG8Q8ND04 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SMG8Q8ND04 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMG8Q8ND04 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMG8Q8ND04 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMG8Q8ND04 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMG8Q8ND04 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMG8Q8ND04 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMG8Q8ND04 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMG8Q8ND04 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMG8Q8ND04 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMG8Q8ND04 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMG8Q8ND04 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMG8Q8ND04 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMG8Q8ND04 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMG8Q8ND04 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMG8Q8ND04 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMG8Q8ND04 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMG8Q8ND04 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMG8Q8ND04 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMG8Q8ND04 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMG8Q8ND04 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMG8Q8ND04 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMG8Q8ND04 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
SMG8Q8ND04 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SMG8Q8ND04 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SMG8Q8ND04 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMG8Q8ND04 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMG8Q8ND04 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMG8Q8ND04 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMG8Q8ND04 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMG8Q8ND04 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMG8Q8ND04 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMG8Q8ND04 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMG8Q8ND04 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMG8Q8ND04 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMG8Q8ND04 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMG8Q8ND04 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMG8Q8ND04 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMG8Q8ND04 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMG8Q8ND04 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMG8Q8ND04 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMG8Q8ND04 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMG8Q8ND04 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMG8Q8ND04 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMG8Q8ND04 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMG8Q8ND04 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMG8Q8ND04 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMG8Q8ND04 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMG8Q8ND04 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMG8Q8ND04 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMG8Q8ND04 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMG8Q8ND04 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMG8Q8ND04 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMG8Q8ND04 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMG8Q8ND04 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMG8Q8ND04 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMG8Q8ND04 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMG8Q8ND04 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMG8Q8ND04 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMG8Q8ND04 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMG8Q8ND04 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMG8Q8ND04 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMG8Q8ND04 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMG8Q8ND04 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMG8Q8ND04 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMG8Q8ND04 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMG8Q8ND04 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMG8Q8ND04 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMG8Q8ND04 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMG8Q8ND04 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMG8Q8ND04 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMG8Q8ND04 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMG8Q8ND04 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMG8Q8ND04 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMG8Q8ND04 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SMG8Q8ND04 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMG8Q8ND04 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMG8Q8ND04 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMG8Q8ND04 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMG8Q8ND04 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMG8Q8ND04 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMG8Q8ND04 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMG8Q8ND04 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMG8Q8ND04 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMG8Q8ND04 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMG8Q8ND04 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMG8Q8ND04 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMG8Q8ND04 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMG8Q8ND04 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SMG8Q8ND04 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMG8Q8ND04 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMG8Q8ND04 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SMG8Q8ND04 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMG8Q8ND04 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMG8Q8ND04 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMG8Q8ND04 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMG8Q8ND04 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms