Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCN5

PDPR, Pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDPRQ8NCN5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDPRQ8NCN5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDPRQ8NCN5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDPRQ8NCN5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDPRQ8NCN5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDPRQ8NCN5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDPRQ8NCN5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDPRQ8NCN5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDPRQ8NCN5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDPRQ8NCN5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDPRQ8NCN5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDPRQ8NCN5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDPRQ8NCN5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDPRQ8NCN5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDPRQ8NCN5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PDPRQ8NCN5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDPRQ8NCN5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDPRQ8NCN5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDPRQ8NCN5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDPRQ8NCN5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDPRQ8NCN5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDPRQ8NCN5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDPRQ8NCN5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDPRQ8NCN5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDPRQ8NCN5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDPRQ8NCN5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDPRQ8NCN5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDPRQ8NCN5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDPRQ8NCN5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDPRQ8NCN5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDPRQ8NCN5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDPRQ8NCN5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PDPRQ8NCN5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PDPRQ8NCN5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDPRQ8NCN5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDPRQ8NCN5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDPRQ8NCN5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDPRQ8NCN5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDPRQ8NCN5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDPRQ8NCN5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDPRQ8NCN5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDPRQ8NCN5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDPRQ8NCN5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDPRQ8NCN5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDPRQ8NCN5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDPRQ8NCN5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDPRQ8NCN5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDPRQ8NCN5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDPRQ8NCN5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDPRQ8NCN5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDPRQ8NCN5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDPRQ8NCN5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PDPRQ8NCN5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PDPRQ8NCN5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDPRQ8NCN5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDPRQ8NCN5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDPRQ8NCN5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDPRQ8NCN5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDPRQ8NCN5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDPRQ8NCN5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDPRQ8NCN5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDPRQ8NCN5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDPRQ8NCN5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDPRQ8NCN5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDPRQ8NCN5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PDPRQ8NCN5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDPRQ8NCN5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDPRQ8NCN5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDPRQ8NCN5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDPRQ8NCN5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDPRQ8NCN5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDPRQ8NCN5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDPRQ8NCN5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDPRQ8NCN5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDPRQ8NCN5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDPRQ8NCN5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDPRQ8NCN5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PDPRQ8NCN5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDPRQ8NCN5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDPRQ8NCN5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDPRQ8NCN5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDPRQ8NCN5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDPRQ8NCN5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDPRQ8NCN5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDPRQ8NCN5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDPRQ8NCN5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDPRQ8NCN5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDPRQ8NCN5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PDPRQ8NCN5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDPRQ8NCN5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDPRQ8NCN5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDPRQ8NCN5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDPRQ8NCN5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDPRQ8NCN5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDPRQ8NCN5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDPRQ8NCN5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDPRQ8NCN5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDPRQ8NCN5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDPRQ8NCN5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDPRQ8NCN5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms