Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBK3

SUMF1, Sulfatase-modifying factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMF1Q8NBK3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SUMF1Q8NBK3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SUMF1Q8NBK3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SUMF1Q8NBK3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SUMF1Q8NBK3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SUMF1Q8NBK3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SUMF1Q8NBK3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SUMF1Q8NBK3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUMF1Q8NBK3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUMF1Q8NBK3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUMF1Q8NBK3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUMF1Q8NBK3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUMF1Q8NBK3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SUMF1Q8NBK3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUMF1Q8NBK3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUMF1Q8NBK3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUMF1Q8NBK3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUMF1Q8NBK3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SUMF1Q8NBK3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SUMF1Q8NBK3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SUMF1Q8NBK3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SUMF1Q8NBK3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SUMF1Q8NBK3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SUMF1Q8NBK3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SUMF1Q8NBK3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SUMF1Q8NBK3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUMF1Q8NBK3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUMF1Q8NBK3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUMF1Q8NBK3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SUMF1Q8NBK3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUMF1Q8NBK3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SUMF1Q8NBK3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUMF1Q8NBK3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUMF1Q8NBK3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUMF1Q8NBK3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUMF1Q8NBK3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SUMF1Q8NBK3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUMF1Q8NBK3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUMF1Q8NBK3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUMF1Q8NBK3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUMF1Q8NBK3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUMF1Q8NBK3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUMF1Q8NBK3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SUMF1Q8NBK3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SUMF1Q8NBK3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SUMF1Q8NBK3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SUMF1Q8NBK3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SUMF1Q8NBK3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SUMF1Q8NBK3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SUMF1Q8NBK3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SUMF1Q8NBK3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SUMF1Q8NBK3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SUMF1Q8NBK3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUMF1Q8NBK3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUMF1Q8NBK3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SUMF1Q8NBK3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUMF1Q8NBK3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUMF1Q8NBK3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUMF1Q8NBK3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUMF1Q8NBK3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUMF1Q8NBK3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUMF1Q8NBK3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUMF1Q8NBK3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SUMF1Q8NBK3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SUMF1Q8NBK3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUMF1Q8NBK3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUMF1Q8NBK3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SUMF1Q8NBK3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SUMF1Q8NBK3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SUMF1Q8NBK3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SUMF1Q8NBK3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SUMF1Q8NBK3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SUMF1Q8NBK3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SUMF1Q8NBK3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SUMF1Q8NBK3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUMF1Q8NBK3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUMF1Q8NBK3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUMF1Q8NBK3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SUMF1Q8NBK3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SUMF1Q8NBK3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SUMF1Q8NBK3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUMF1Q8NBK3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUMF1Q8NBK3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUMF1Q8NBK3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUMF1Q8NBK3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUMF1Q8NBK3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SUMF1Q8NBK3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SUMF1Q8NBK3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUMF1Q8NBK3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUMF1Q8NBK3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SUMF1Q8NBK3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUMF1Q8NBK3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUMF1Q8NBK3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUMF1Q8NBK3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUMF1Q8NBK3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUMF1Q8NBK3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUMF1Q8NBK3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUMF1Q8NBK3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUMF1Q8NBK3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUMF1Q8NBK3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms