Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9Z9

LMNTD1, Lamin tail domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD1Q8N9Z9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMNTD1Q8N9Z9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMNTD1Q8N9Z9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMNTD1Q8N9Z9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMNTD1Q8N9Z9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMNTD1Q8N9Z9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMNTD1Q8N9Z9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMNTD1Q8N9Z9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMNTD1Q8N9Z9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMNTD1Q8N9Z9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMNTD1Q8N9Z9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMNTD1Q8N9Z9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMNTD1Q8N9Z9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMNTD1Q8N9Z9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LMNTD1Q8N9Z9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMNTD1Q8N9Z9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMNTD1Q8N9Z9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMNTD1Q8N9Z9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMNTD1Q8N9Z9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMNTD1Q8N9Z9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMNTD1Q8N9Z9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMNTD1Q8N9Z9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMNTD1Q8N9Z9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMNTD1Q8N9Z9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMNTD1Q8N9Z9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LMNTD1Q8N9Z9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMNTD1Q8N9Z9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LMNTD1Q8N9Z9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LMNTD1Q8N9Z9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMNTD1Q8N9Z9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMNTD1Q8N9Z9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMNTD1Q8N9Z9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LMNTD1Q8N9Z9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMNTD1Q8N9Z9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMNTD1Q8N9Z9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMNTD1Q8N9Z9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMNTD1Q8N9Z9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMNTD1Q8N9Z9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMNTD1Q8N9Z9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMNTD1Q8N9Z9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMNTD1Q8N9Z9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMNTD1Q8N9Z9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LMNTD1Q8N9Z9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LMNTD1Q8N9Z9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMNTD1Q8N9Z9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LMNTD1Q8N9Z9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMNTD1Q8N9Z9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMNTD1Q8N9Z9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMNTD1Q8N9Z9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMNTD1Q8N9Z9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMNTD1Q8N9Z9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMNTD1Q8N9Z9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMNTD1Q8N9Z9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMNTD1Q8N9Z9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMNTD1Q8N9Z9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMNTD1Q8N9Z9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMNTD1Q8N9Z9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMNTD1Q8N9Z9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMNTD1Q8N9Z9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LMNTD1Q8N9Z9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMNTD1Q8N9Z9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMNTD1Q8N9Z9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMNTD1Q8N9Z9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMNTD1Q8N9Z9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMNTD1Q8N9Z9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMNTD1Q8N9Z9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMNTD1Q8N9Z9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMNTD1Q8N9Z9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMNTD1Q8N9Z9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMNTD1Q8N9Z9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMNTD1Q8N9Z9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMNTD1Q8N9Z9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMNTD1Q8N9Z9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMNTD1Q8N9Z9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMNTD1Q8N9Z9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMNTD1Q8N9Z9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMNTD1Q8N9Z9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMNTD1Q8N9Z9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMNTD1Q8N9Z9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMNTD1Q8N9Z9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMNTD1Q8N9Z9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMNTD1Q8N9Z9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMNTD1Q8N9Z9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LMNTD1Q8N9Z9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMNTD1Q8N9Z9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMNTD1Q8N9Z9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMNTD1Q8N9Z9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMNTD1Q8N9Z9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMNTD1Q8N9Z9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMNTD1Q8N9Z9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMNTD1Q8N9Z9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMNTD1Q8N9Z9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMNTD1Q8N9Z9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LMNTD1Q8N9Z9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMNTD1Q8N9Z9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMNTD1Q8N9Z9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMNTD1Q8N9Z9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMNTD1Q8N9Z9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMNTD1Q8N9Z9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMNTD1Q8N9Z9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms