Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM71DQ8N9W8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM71DQ8N9W8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM71DQ8N9W8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM71DQ8N9W8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM71DQ8N9W8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM71DQ8N9W8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM71DQ8N9W8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM71DQ8N9W8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM71DQ8N9W8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM71DQ8N9W8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM71DQ8N9W8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM71DQ8N9W8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM71DQ8N9W8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM71DQ8N9W8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM71DQ8N9W8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM71DQ8N9W8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM71DQ8N9W8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM71DQ8N9W8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM71DQ8N9W8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM71DQ8N9W8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM71DQ8N9W8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM71DQ8N9W8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM71DQ8N9W8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM71DQ8N9W8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM71DQ8N9W8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM71DQ8N9W8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM71DQ8N9W8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM71DQ8N9W8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM71DQ8N9W8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM71DQ8N9W8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM71DQ8N9W8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM71DQ8N9W8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM71DQ8N9W8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM71DQ8N9W8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM71DQ8N9W8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM71DQ8N9W8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM71DQ8N9W8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM71DQ8N9W8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM71DQ8N9W8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM71DQ8N9W8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM71DQ8N9W8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM71DQ8N9W8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM71DQ8N9W8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM71DQ8N9W8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM71DQ8N9W8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM71DQ8N9W8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM71DQ8N9W8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM71DQ8N9W8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM71DQ8N9W8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FAM71DQ8N9W8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
FAM71DQ8N9W8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FAM71DQ8N9W8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FAM71DQ8N9W8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM71DQ8N9W8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM71DQ8N9W8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM71DQ8N9W8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM71DQ8N9W8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM71DQ8N9W8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM71DQ8N9W8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM71DQ8N9W8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM71DQ8N9W8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM71DQ8N9W8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM71DQ8N9W8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM71DQ8N9W8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM71DQ8N9W8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM71DQ8N9W8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM71DQ8N9W8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM71DQ8N9W8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM71DQ8N9W8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM71DQ8N9W8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM71DQ8N9W8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM71DQ8N9W8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM71DQ8N9W8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM71DQ8N9W8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM71DQ8N9W8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM71DQ8N9W8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM71DQ8N9W8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM71DQ8N9W8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM71DQ8N9W8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM71DQ8N9W8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM71DQ8N9W8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM71DQ8N9W8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM71DQ8N9W8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM71DQ8N9W8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM71DQ8N9W8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM71DQ8N9W8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM71DQ8N9W8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM71DQ8N9W8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM71DQ8N9W8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM71DQ8N9W8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM71DQ8N9W8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM71DQ8N9W8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM71DQ8N9W8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM71DQ8N9W8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM71DQ8N9W8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM71DQ8N9W8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM71DQ8N9W8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM71DQ8N9W8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM71DQ8N9W8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms