Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6N2

TTC9B, Tetratricopeptide repeat protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9BQ8N6N2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC9BQ8N6N2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC9BQ8N6N2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC9BQ8N6N2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC9BQ8N6N2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC9BQ8N6N2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC9BQ8N6N2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC9BQ8N6N2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC9BQ8N6N2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC9BQ8N6N2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC9BQ8N6N2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC9BQ8N6N2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC9BQ8N6N2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC9BQ8N6N2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC9BQ8N6N2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC9BQ8N6N2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC9BQ8N6N2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC9BQ8N6N2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC9BQ8N6N2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC9BQ8N6N2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC9BQ8N6N2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC9BQ8N6N2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC9BQ8N6N2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC9BQ8N6N2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC9BQ8N6N2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC9BQ8N6N2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC9BQ8N6N2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC9BQ8N6N2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC9BQ8N6N2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC9BQ8N6N2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC9BQ8N6N2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC9BQ8N6N2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC9BQ8N6N2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC9BQ8N6N2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC9BQ8N6N2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC9BQ8N6N2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC9BQ8N6N2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC9BQ8N6N2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC9BQ8N6N2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC9BQ8N6N2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC9BQ8N6N2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC9BQ8N6N2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC9BQ8N6N2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC9BQ8N6N2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC9BQ8N6N2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC9BQ8N6N2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC9BQ8N6N2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC9BQ8N6N2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC9BQ8N6N2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC9BQ8N6N2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC9BQ8N6N2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC9BQ8N6N2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC9BQ8N6N2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC9BQ8N6N2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC9BQ8N6N2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC9BQ8N6N2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC9BQ8N6N2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC9BQ8N6N2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC9BQ8N6N2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC9BQ8N6N2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC9BQ8N6N2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC9BQ8N6N2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC9BQ8N6N2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC9BQ8N6N2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC9BQ8N6N2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC9BQ8N6N2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC9BQ8N6N2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC9BQ8N6N2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC9BQ8N6N2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC9BQ8N6N2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC9BQ8N6N2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC9BQ8N6N2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC9BQ8N6N2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC9BQ8N6N2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC9BQ8N6N2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC9BQ8N6N2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC9BQ8N6N2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC9BQ8N6N2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC9BQ8N6N2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC9BQ8N6N2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC9BQ8N6N2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC9BQ8N6N2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC9BQ8N6N2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC9BQ8N6N2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC9BQ8N6N2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC9BQ8N6N2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC9BQ8N6N2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC9BQ8N6N2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC9BQ8N6N2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TTC9BQ8N6N2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TTC9BQ8N6N2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC9BQ8N6N2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC9BQ8N6N2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC9BQ8N6N2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC9BQ8N6N2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC9BQ8N6N2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC9BQ8N6N2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC9BQ8N6N2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC9BQ8N6N2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC9BQ8N6N2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms