Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC155Q8N6L0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC155Q8N6L0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC155Q8N6L0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC155Q8N6L0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC155Q8N6L0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC155Q8N6L0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC155Q8N6L0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC155Q8N6L0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC155Q8N6L0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC155Q8N6L0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC155Q8N6L0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC155Q8N6L0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC155Q8N6L0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC155Q8N6L0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC155Q8N6L0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC155Q8N6L0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC155Q8N6L0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC155Q8N6L0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC155Q8N6L0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC155Q8N6L0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC155Q8N6L0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC155Q8N6L0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC155Q8N6L0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC155Q8N6L0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC155Q8N6L0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC155Q8N6L0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC155Q8N6L0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC155Q8N6L0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC155Q8N6L0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC155Q8N6L0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC155Q8N6L0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC155Q8N6L0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC155Q8N6L0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC155Q8N6L0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC155Q8N6L0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC155Q8N6L0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC155Q8N6L0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC155Q8N6L0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC155Q8N6L0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC155Q8N6L0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC155Q8N6L0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC155Q8N6L0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC155Q8N6L0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC155Q8N6L0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC155Q8N6L0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC155Q8N6L0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC155Q8N6L0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC155Q8N6L0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC155Q8N6L0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC155Q8N6L0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC155Q8N6L0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC155Q8N6L0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC155Q8N6L0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC155Q8N6L0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC155Q8N6L0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC155Q8N6L0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC155Q8N6L0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC155Q8N6L0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC155Q8N6L0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC155Q8N6L0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC155Q8N6L0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC155Q8N6L0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC155Q8N6L0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC155Q8N6L0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC155Q8N6L0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC155Q8N6L0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC155Q8N6L0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC155Q8N6L0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC155Q8N6L0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC155Q8N6L0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC155Q8N6L0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC155Q8N6L0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC155Q8N6L0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC155Q8N6L0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC155Q8N6L0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC155Q8N6L0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC155Q8N6L0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC155Q8N6L0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC155Q8N6L0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC155Q8N6L0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC155Q8N6L0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC155Q8N6L0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC155Q8N6L0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC155Q8N6L0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC155Q8N6L0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC155Q8N6L0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC155Q8N6L0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC155Q8N6L0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC155Q8N6L0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC155Q8N6L0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC155Q8N6L0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC155Q8N6L0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC155Q8N6L0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC155Q8N6L0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC155Q8N6L0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC155Q8N6L0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC155Q8N6L0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC155Q8N6L0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC155Q8N6L0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms