Protein–RNA interactions for Protein: Q8N309

LRRC43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, humanhuman

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC43Q8N309 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC43Q8N309 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC43Q8N309 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC43Q8N309 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC43Q8N309 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC43Q8N309 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC43Q8N309 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC43Q8N309 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC43Q8N309 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC43Q8N309 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC43Q8N309 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC43Q8N309 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC43Q8N309 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC43Q8N309 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC43Q8N309 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC43Q8N309 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC43Q8N309 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC43Q8N309 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC43Q8N309 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC43Q8N309 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC43Q8N309 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC43Q8N309 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC43Q8N309 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC43Q8N309 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC43Q8N309 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC43Q8N309 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC43Q8N309 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC43Q8N309 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC43Q8N309 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC43Q8N309 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC43Q8N309 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC43Q8N309 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC43Q8N309 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC43Q8N309 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
LRRC43Q8N309 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LRRC43Q8N309 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC43Q8N309 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC43Q8N309 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC43Q8N309 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC43Q8N309 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC43Q8N309 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC43Q8N309 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC43Q8N309 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC43Q8N309 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC43Q8N309 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC43Q8N309 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC43Q8N309 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC43Q8N309 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC43Q8N309 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC43Q8N309 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC43Q8N309 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC43Q8N309 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC43Q8N309 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC43Q8N309 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC43Q8N309 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC43Q8N309 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC43Q8N309 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC43Q8N309 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC43Q8N309 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC43Q8N309 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC43Q8N309 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC43Q8N309 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC43Q8N309 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC43Q8N309 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC43Q8N309 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC43Q8N309 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC43Q8N309 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC43Q8N309 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC43Q8N309 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC43Q8N309 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC43Q8N309 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC43Q8N309 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC43Q8N309 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC43Q8N309 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC43Q8N309 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC43Q8N309 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC43Q8N309 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC43Q8N309 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC43Q8N309 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC43Q8N309 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC43Q8N309 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC43Q8N309 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC43Q8N309 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC43Q8N309 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC43Q8N309 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC43Q8N309 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC43Q8N309 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC43Q8N309 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC43Q8N309 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC43Q8N309 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC43Q8N309 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC43Q8N309 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC43Q8N309 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC43Q8N309 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC43Q8N309 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC43Q8N309 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC43Q8N309 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC43Q8N309 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC43Q8N309 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC43Q8N309 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
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