Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GPC2Q8N158 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GPC2Q8N158 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GPC2Q8N158 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GPC2Q8N158 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GPC2Q8N158 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
GPC2Q8N158 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GPC2Q8N158 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GPC2Q8N158 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GPC2Q8N158 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GPC2Q8N158 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
GPC2Q8N158 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GPC2Q8N158 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GPC2Q8N158 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GPC2Q8N158 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GPC2Q8N158 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GPC2Q8N158 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GPC2Q8N158 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GPC2Q8N158 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
GPC2Q8N158 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GPC2Q8N158 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GPC2Q8N158 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GPC2Q8N158 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GPC2Q8N158 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GPC2Q8N158 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GPC2Q8N158 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GPC2Q8N158 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GPC2Q8N158 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GPC2Q8N158 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GPC2Q8N158 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
GPC2Q8N158 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GPC2Q8N158 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GPC2Q8N158 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GPC2Q8N158 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GPC2Q8N158 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GPC2Q8N158 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
GPC2Q8N158 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GPC2Q8N158 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GPC2Q8N158 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GPC2Q8N158 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
GPC2Q8N158 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
GPC2Q8N158 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
GPC2Q8N158 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
GPC2Q8N158 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
GPC2Q8N158 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
GPC2Q8N158 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GPC2Q8N158 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GPC2Q8N158 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GPC2Q8N158 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GPC2Q8N158 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GPC2Q8N158 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
GPC2Q8N158 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GPC2Q8N158 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GPC2Q8N158 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GPC2Q8N158 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GPC2Q8N158 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GPC2Q8N158 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GPC2Q8N158 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GPC2Q8N158 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GPC2Q8N158 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GPC2Q8N158 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GPC2Q8N158 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GPC2Q8N158 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
GPC2Q8N158 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GPC2Q8N158 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GPC2Q8N158 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GPC2Q8N158 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GPC2Q8N158 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GPC2Q8N158 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GPC2Q8N158 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GPC2Q8N158 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GPC2Q8N158 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GPC2Q8N158 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GPC2Q8N158 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GPC2Q8N158 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
GPC2Q8N158 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
GPC2Q8N158 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
GPC2Q8N158 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GPC2Q8N158 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GPC2Q8N158 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GPC2Q8N158 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GPC2Q8N158 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GPC2Q8N158 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GPC2Q8N158 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GPC2Q8N158 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GPC2Q8N158 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GPC2Q8N158 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GPC2Q8N158 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GPC2Q8N158 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GPC2Q8N158 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GPC2Q8N158 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GPC2Q8N158 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GPC2Q8N158 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GPC2Q8N158 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GPC2Q8N158 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GPC2Q8N158 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GPC2Q8N158 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GPC2Q8N158 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GPC2Q8N158 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GPC2Q8N158 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms