Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYCP3Q8IZU3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYCP3Q8IZU3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYCP3Q8IZU3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYCP3Q8IZU3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYCP3Q8IZU3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYCP3Q8IZU3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYCP3Q8IZU3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYCP3Q8IZU3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYCP3Q8IZU3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SYCP3Q8IZU3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYCP3Q8IZU3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYCP3Q8IZU3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYCP3Q8IZU3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYCP3Q8IZU3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYCP3Q8IZU3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYCP3Q8IZU3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYCP3Q8IZU3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SYCP3Q8IZU3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYCP3Q8IZU3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYCP3Q8IZU3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYCP3Q8IZU3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYCP3Q8IZU3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYCP3Q8IZU3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYCP3Q8IZU3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYCP3Q8IZU3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYCP3Q8IZU3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYCP3Q8IZU3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYCP3Q8IZU3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYCP3Q8IZU3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYCP3Q8IZU3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYCP3Q8IZU3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYCP3Q8IZU3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SYCP3Q8IZU3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYCP3Q8IZU3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYCP3Q8IZU3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYCP3Q8IZU3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYCP3Q8IZU3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYCP3Q8IZU3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYCP3Q8IZU3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYCP3Q8IZU3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SYCP3Q8IZU3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYCP3Q8IZU3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SYCP3Q8IZU3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYCP3Q8IZU3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYCP3Q8IZU3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SYCP3Q8IZU3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYCP3Q8IZU3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SYCP3Q8IZU3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYCP3Q8IZU3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYCP3Q8IZU3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYCP3Q8IZU3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYCP3Q8IZU3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYCP3Q8IZU3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYCP3Q8IZU3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYCP3Q8IZU3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYCP3Q8IZU3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYCP3Q8IZU3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYCP3Q8IZU3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYCP3Q8IZU3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYCP3Q8IZU3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYCP3Q8IZU3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYCP3Q8IZU3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYCP3Q8IZU3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYCP3Q8IZU3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYCP3Q8IZU3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYCP3Q8IZU3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYCP3Q8IZU3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYCP3Q8IZU3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYCP3Q8IZU3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYCP3Q8IZU3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYCP3Q8IZU3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYCP3Q8IZU3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYCP3Q8IZU3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SYCP3Q8IZU3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYCP3Q8IZU3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYCP3Q8IZU3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYCP3Q8IZU3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYCP3Q8IZU3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYCP3Q8IZU3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYCP3Q8IZU3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYCP3Q8IZU3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SYCP3Q8IZU3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYCP3Q8IZU3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYCP3Q8IZU3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYCP3Q8IZU3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYCP3Q8IZU3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYCP3Q8IZU3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYCP3Q8IZU3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SYCP3Q8IZU3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYCP3Q8IZU3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYCP3Q8IZU3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYCP3Q8IZU3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYCP3Q8IZU3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SYCP3Q8IZU3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SYCP3Q8IZU3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYCP3Q8IZU3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYCP3Q8IZU3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYCP3Q8IZU3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYCP3Q8IZU3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms