Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ21

PHACTR4, Phosphatase and actin regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR4Q8IZ21 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHACTR4Q8IZ21 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHACTR4Q8IZ21 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHACTR4Q8IZ21 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHACTR4Q8IZ21 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHACTR4Q8IZ21 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHACTR4Q8IZ21 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHACTR4Q8IZ21 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHACTR4Q8IZ21 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHACTR4Q8IZ21 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHACTR4Q8IZ21 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHACTR4Q8IZ21 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHACTR4Q8IZ21 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHACTR4Q8IZ21 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHACTR4Q8IZ21 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHACTR4Q8IZ21 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHACTR4Q8IZ21 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHACTR4Q8IZ21 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHACTR4Q8IZ21 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHACTR4Q8IZ21 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHACTR4Q8IZ21 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHACTR4Q8IZ21 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHACTR4Q8IZ21 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PHACTR4Q8IZ21 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHACTR4Q8IZ21 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHACTR4Q8IZ21 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHACTR4Q8IZ21 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHACTR4Q8IZ21 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHACTR4Q8IZ21 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHACTR4Q8IZ21 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHACTR4Q8IZ21 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHACTR4Q8IZ21 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHACTR4Q8IZ21 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHACTR4Q8IZ21 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHACTR4Q8IZ21 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHACTR4Q8IZ21 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHACTR4Q8IZ21 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHACTR4Q8IZ21 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHACTR4Q8IZ21 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHACTR4Q8IZ21 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHACTR4Q8IZ21 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHACTR4Q8IZ21 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHACTR4Q8IZ21 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHACTR4Q8IZ21 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHACTR4Q8IZ21 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHACTR4Q8IZ21 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHACTR4Q8IZ21 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHACTR4Q8IZ21 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHACTR4Q8IZ21 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHACTR4Q8IZ21 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHACTR4Q8IZ21 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHACTR4Q8IZ21 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHACTR4Q8IZ21 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PHACTR4Q8IZ21 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PHACTR4Q8IZ21 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHACTR4Q8IZ21 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHACTR4Q8IZ21 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHACTR4Q8IZ21 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHACTR4Q8IZ21 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHACTR4Q8IZ21 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PHACTR4Q8IZ21 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHACTR4Q8IZ21 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHACTR4Q8IZ21 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHACTR4Q8IZ21 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PHACTR4Q8IZ21 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHACTR4Q8IZ21 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHACTR4Q8IZ21 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHACTR4Q8IZ21 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHACTR4Q8IZ21 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHACTR4Q8IZ21 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHACTR4Q8IZ21 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHACTR4Q8IZ21 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PHACTR4Q8IZ21 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHACTR4Q8IZ21 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHACTR4Q8IZ21 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHACTR4Q8IZ21 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHACTR4Q8IZ21 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHACTR4Q8IZ21 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHACTR4Q8IZ21 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHACTR4Q8IZ21 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PHACTR4Q8IZ21 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PHACTR4Q8IZ21 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHACTR4Q8IZ21 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHACTR4Q8IZ21 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHACTR4Q8IZ21 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHACTR4Q8IZ21 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHACTR4Q8IZ21 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PHACTR4Q8IZ21 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHACTR4Q8IZ21 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHACTR4Q8IZ21 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHACTR4Q8IZ21 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHACTR4Q8IZ21 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHACTR4Q8IZ21 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHACTR4Q8IZ21 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHACTR4Q8IZ21 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHACTR4Q8IZ21 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHACTR4Q8IZ21 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHACTR4Q8IZ21 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHACTR4Q8IZ21 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PHACTR4Q8IZ21 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms