Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWL2

SFTPA1, Pulmonary surfactant-associated protein A1, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPA1Q8IWL2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SFTPA1Q8IWL2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SFTPA1Q8IWL2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SFTPA1Q8IWL2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SFTPA1Q8IWL2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SFTPA1Q8IWL2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SFTPA1Q8IWL2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SFTPA1Q8IWL2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SFTPA1Q8IWL2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SFTPA1Q8IWL2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SFTPA1Q8IWL2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SFTPA1Q8IWL2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SFTPA1Q8IWL2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SFTPA1Q8IWL2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SFTPA1Q8IWL2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SFTPA1Q8IWL2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SFTPA1Q8IWL2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SFTPA1Q8IWL2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SFTPA1Q8IWL2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SFTPA1Q8IWL2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SFTPA1Q8IWL2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SFTPA1Q8IWL2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFTPA1Q8IWL2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFTPA1Q8IWL2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFTPA1Q8IWL2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFTPA1Q8IWL2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFTPA1Q8IWL2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFTPA1Q8IWL2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFTPA1Q8IWL2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFTPA1Q8IWL2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFTPA1Q8IWL2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFTPA1Q8IWL2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFTPA1Q8IWL2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFTPA1Q8IWL2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFTPA1Q8IWL2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFTPA1Q8IWL2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFTPA1Q8IWL2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFTPA1Q8IWL2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFTPA1Q8IWL2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SFTPA1Q8IWL2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SFTPA1Q8IWL2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SFTPA1Q8IWL2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SFTPA1Q8IWL2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFTPA1Q8IWL2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFTPA1Q8IWL2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFTPA1Q8IWL2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFTPA1Q8IWL2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFTPA1Q8IWL2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFTPA1Q8IWL2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFTPA1Q8IWL2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFTPA1Q8IWL2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFTPA1Q8IWL2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFTPA1Q8IWL2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFTPA1Q8IWL2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SFTPA1Q8IWL2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SFTPA1Q8IWL2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SFTPA1Q8IWL2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SFTPA1Q8IWL2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SFTPA1Q8IWL2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SFTPA1Q8IWL2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SFTPA1Q8IWL2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SFTPA1Q8IWL2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SFTPA1Q8IWL2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SFTPA1Q8IWL2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SFTPA1Q8IWL2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SFTPA1Q8IWL2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SFTPA1Q8IWL2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SFTPA1Q8IWL2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SFTPA1Q8IWL2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SFTPA1Q8IWL2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SFTPA1Q8IWL2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SFTPA1Q8IWL2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SFTPA1Q8IWL2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SFTPA1Q8IWL2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SFTPA1Q8IWL2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SFTPA1Q8IWL2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SFTPA1Q8IWL2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SFTPA1Q8IWL2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SFTPA1Q8IWL2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SFTPA1Q8IWL2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SFTPA1Q8IWL2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SFTPA1Q8IWL2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SFTPA1Q8IWL2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SFTPA1Q8IWL2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SFTPA1Q8IWL2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SFTPA1Q8IWL2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SFTPA1Q8IWL2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SFTPA1Q8IWL2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SFTPA1Q8IWL2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SFTPA1Q8IWL2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SFTPA1Q8IWL2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SFTPA1Q8IWL2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SFTPA1Q8IWL2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SFTPA1Q8IWL2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SFTPA1Q8IWL2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SFTPA1Q8IWL2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SFTPA1Q8IWL2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SFTPA1Q8IWL2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SFTPA1Q8IWL2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SFTPA1Q8IWL2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms