Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX29P2Q8IUI4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX29P2Q8IUI4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX29P2Q8IUI4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX29P2Q8IUI4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX29P2Q8IUI4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX29P2Q8IUI4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX29P2Q8IUI4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX29P2Q8IUI4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX29P2Q8IUI4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX29P2Q8IUI4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX29P2Q8IUI4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX29P2Q8IUI4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX29P2Q8IUI4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX29P2Q8IUI4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX29P2Q8IUI4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX29P2Q8IUI4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX29P2Q8IUI4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX29P2Q8IUI4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX29P2Q8IUI4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX29P2Q8IUI4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX29P2Q8IUI4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX29P2Q8IUI4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX29P2Q8IUI4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX29P2Q8IUI4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX29P2Q8IUI4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX29P2Q8IUI4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX29P2Q8IUI4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX29P2Q8IUI4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX29P2Q8IUI4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX29P2Q8IUI4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX29P2Q8IUI4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX29P2Q8IUI4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX29P2Q8IUI4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX29P2Q8IUI4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX29P2Q8IUI4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX29P2Q8IUI4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX29P2Q8IUI4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX29P2Q8IUI4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX29P2Q8IUI4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX29P2Q8IUI4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX29P2Q8IUI4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX29P2Q8IUI4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX29P2Q8IUI4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX29P2Q8IUI4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX29P2Q8IUI4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX29P2Q8IUI4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX29P2Q8IUI4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX29P2Q8IUI4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX29P2Q8IUI4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX29P2Q8IUI4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX29P2Q8IUI4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX29P2Q8IUI4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX29P2Q8IUI4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX29P2Q8IUI4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX29P2Q8IUI4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX29P2Q8IUI4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX29P2Q8IUI4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX29P2Q8IUI4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX29P2Q8IUI4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX29P2Q8IUI4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX29P2Q8IUI4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX29P2Q8IUI4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX29P2Q8IUI4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX29P2Q8IUI4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX29P2Q8IUI4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX29P2Q8IUI4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX29P2Q8IUI4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNX29P2Q8IUI4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX29P2Q8IUI4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX29P2Q8IUI4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX29P2Q8IUI4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX29P2Q8IUI4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX29P2Q8IUI4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX29P2Q8IUI4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX29P2Q8IUI4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX29P2Q8IUI4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX29P2Q8IUI4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX29P2Q8IUI4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX29P2Q8IUI4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX29P2Q8IUI4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX29P2Q8IUI4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX29P2Q8IUI4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX29P2Q8IUI4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX29P2Q8IUI4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX29P2Q8IUI4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX29P2Q8IUI4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX29P2Q8IUI4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX29P2Q8IUI4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX29P2Q8IUI4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX29P2Q8IUI4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX29P2Q8IUI4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX29P2Q8IUI4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX29P2Q8IUI4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX29P2Q8IUI4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX29P2Q8IUI4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX29P2Q8IUI4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX29P2Q8IUI4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX29P2Q8IUI4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX29P2Q8IUI4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms