Protein–RNA interactions for Protein: Q86YD3

TMEM25, Transmembrane protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM25Q86YD3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM25Q86YD3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM25Q86YD3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM25Q86YD3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM25Q86YD3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM25Q86YD3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM25Q86YD3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM25Q86YD3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM25Q86YD3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM25Q86YD3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM25Q86YD3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM25Q86YD3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMEM25Q86YD3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMEM25Q86YD3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMEM25Q86YD3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM25Q86YD3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM25Q86YD3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM25Q86YD3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM25Q86YD3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM25Q86YD3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM25Q86YD3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM25Q86YD3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM25Q86YD3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM25Q86YD3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM25Q86YD3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM25Q86YD3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM25Q86YD3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM25Q86YD3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM25Q86YD3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM25Q86YD3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM25Q86YD3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM25Q86YD3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM25Q86YD3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM25Q86YD3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM25Q86YD3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM25Q86YD3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM25Q86YD3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM25Q86YD3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM25Q86YD3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM25Q86YD3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM25Q86YD3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM25Q86YD3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM25Q86YD3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM25Q86YD3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM25Q86YD3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM25Q86YD3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM25Q86YD3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM25Q86YD3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM25Q86YD3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM25Q86YD3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM25Q86YD3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM25Q86YD3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM25Q86YD3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM25Q86YD3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM25Q86YD3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM25Q86YD3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM25Q86YD3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM25Q86YD3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM25Q86YD3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM25Q86YD3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM25Q86YD3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM25Q86YD3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM25Q86YD3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM25Q86YD3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM25Q86YD3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM25Q86YD3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM25Q86YD3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM25Q86YD3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM25Q86YD3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM25Q86YD3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM25Q86YD3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM25Q86YD3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM25Q86YD3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TMEM25Q86YD3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM25Q86YD3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM25Q86YD3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM25Q86YD3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM25Q86YD3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM25Q86YD3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM25Q86YD3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM25Q86YD3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM25Q86YD3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM25Q86YD3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM25Q86YD3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM25Q86YD3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM25Q86YD3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM25Q86YD3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM25Q86YD3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM25Q86YD3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM25Q86YD3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM25Q86YD3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM25Q86YD3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM25Q86YD3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM25Q86YD3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM25Q86YD3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM25Q86YD3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM25Q86YD3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM25Q86YD3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM25Q86YD3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM25Q86YD3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms