Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KCNMB4Q86W47 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KCNMB4Q86W47 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNMB4Q86W47 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNMB4Q86W47 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNMB4Q86W47 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNMB4Q86W47 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNMB4Q86W47 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNMB4Q86W47 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNMB4Q86W47 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNMB4Q86W47 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNMB4Q86W47 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNMB4Q86W47 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNMB4Q86W47 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNMB4Q86W47 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNMB4Q86W47 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNMB4Q86W47 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNMB4Q86W47 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNMB4Q86W47 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNMB4Q86W47 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNMB4Q86W47 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNMB4Q86W47 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNMB4Q86W47 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNMB4Q86W47 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNMB4Q86W47 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNMB4Q86W47 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNMB4Q86W47 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNMB4Q86W47 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNMB4Q86W47 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNMB4Q86W47 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNMB4Q86W47 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNMB4Q86W47 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNMB4Q86W47 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNMB4Q86W47 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNMB4Q86W47 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNMB4Q86W47 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNMB4Q86W47 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNMB4Q86W47 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNMB4Q86W47 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNMB4Q86W47 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNMB4Q86W47 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNMB4Q86W47 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNMB4Q86W47 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNMB4Q86W47 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNMB4Q86W47 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNMB4Q86W47 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNMB4Q86W47 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNMB4Q86W47 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNMB4Q86W47 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNMB4Q86W47 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNMB4Q86W47 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNMB4Q86W47 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNMB4Q86W47 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNMB4Q86W47 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNMB4Q86W47 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNMB4Q86W47 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNMB4Q86W47 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNMB4Q86W47 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNMB4Q86W47 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNMB4Q86W47 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNMB4Q86W47 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNMB4Q86W47 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNMB4Q86W47 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNMB4Q86W47 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNMB4Q86W47 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNMB4Q86W47 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNMB4Q86W47 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNMB4Q86W47 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNMB4Q86W47 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNMB4Q86W47 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNMB4Q86W47 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KCNMB4Q86W47 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KCNMB4Q86W47 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KCNMB4Q86W47 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KCNMB4Q86W47 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
KCNMB4Q86W47 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KCNMB4Q86W47 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KCNMB4Q86W47 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KCNMB4Q86W47 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KCNMB4Q86W47 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KCNMB4Q86W47 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KCNMB4Q86W47 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KCNMB4Q86W47 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KCNMB4Q86W47 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNMB4Q86W47 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNMB4Q86W47 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNMB4Q86W47 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNMB4Q86W47 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNMB4Q86W47 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNMB4Q86W47 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNMB4Q86W47 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNMB4Q86W47 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNMB4Q86W47 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNMB4Q86W47 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNMB4Q86W47 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNMB4Q86W47 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNMB4Q86W47 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNMB4Q86W47 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNMB4Q86W47 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNMB4Q86W47 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms