Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
APTXQ7Z2E3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
APTXQ7Z2E3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
APTXQ7Z2E3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
APTXQ7Z2E3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
APTXQ7Z2E3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
APTXQ7Z2E3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
APTXQ7Z2E3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
APTXQ7Z2E3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
APTXQ7Z2E3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
APTXQ7Z2E3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
APTXQ7Z2E3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
APTXQ7Z2E3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
APTXQ7Z2E3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
APTXQ7Z2E3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
APTXQ7Z2E3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
APTXQ7Z2E3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
APTXQ7Z2E3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
APTXQ7Z2E3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
APTXQ7Z2E3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
APTXQ7Z2E3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
APTXQ7Z2E3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
APTXQ7Z2E3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
APTXQ7Z2E3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
APTXQ7Z2E3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
APTXQ7Z2E3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
APTXQ7Z2E3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
APTXQ7Z2E3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
APTXQ7Z2E3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
APTXQ7Z2E3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
APTXQ7Z2E3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
APTXQ7Z2E3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
APTXQ7Z2E3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
APTXQ7Z2E3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
APTXQ7Z2E3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
APTXQ7Z2E3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
APTXQ7Z2E3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
APTXQ7Z2E3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
APTXQ7Z2E3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
APTXQ7Z2E3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
APTXQ7Z2E3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
APTXQ7Z2E3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
APTXQ7Z2E3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
APTXQ7Z2E3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
APTXQ7Z2E3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
APTXQ7Z2E3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
APTXQ7Z2E3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
APTXQ7Z2E3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
APTXQ7Z2E3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
APTXQ7Z2E3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
APTXQ7Z2E3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
APTXQ7Z2E3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
APTXQ7Z2E3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
APTXQ7Z2E3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
APTXQ7Z2E3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
APTXQ7Z2E3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
APTXQ7Z2E3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
APTXQ7Z2E3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APTXQ7Z2E3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APTXQ7Z2E3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APTXQ7Z2E3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APTXQ7Z2E3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
APTXQ7Z2E3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APTXQ7Z2E3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
APTXQ7Z2E3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
APTXQ7Z2E3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APTXQ7Z2E3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APTXQ7Z2E3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
APTXQ7Z2E3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
APTXQ7Z2E3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APTXQ7Z2E3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APTXQ7Z2E3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
APTXQ7Z2E3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
APTXQ7Z2E3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
APTXQ7Z2E3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
APTXQ7Z2E3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
APTXQ7Z2E3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
APTXQ7Z2E3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
APTXQ7Z2E3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
APTXQ7Z2E3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APTXQ7Z2E3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APTXQ7Z2E3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
APTXQ7Z2E3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
APTXQ7Z2E3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APTXQ7Z2E3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
APTXQ7Z2E3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APTXQ7Z2E3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
APTXQ7Z2E3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
APTXQ7Z2E3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
APTXQ7Z2E3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
APTXQ7Z2E3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
APTXQ7Z2E3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
APTXQ7Z2E3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
APTXQ7Z2E3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
APTXQ7Z2E3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
APTXQ7Z2E3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
APTXQ7Z2E3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
APTXQ7Z2E3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
APTXQ7Z2E3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
APTXQ7Z2E3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms